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產(chǎn)生抗癌化合物的海洋無脊椎動物的微生物群

導讀 黑色素瘤(最危險的皮膚癌類型)的治療方法是否可以是源自生活在海底的無脊椎動物的化合物?由Alison Murray博士領導的一組科學家。里諾(Reno

黑色素瘤(最危險的皮膚癌類型)的治療方法是否可以是源自生活在海底的無脊椎動物的化合物?由Alison Murray博士領導的一組科學家。里諾(Reno)沙漠研究所(DRI)的研究人員就這么認為,他們正在尋找一種名為Synoicum adareanum的南極海生微生物的微生物組,以更好地了解開發(fā)黑色素瘤特異性藥物的可能性。

海鞘或“海鞘”是原始的,類似于囊的海洋動物,它們生活在世界各地的海洋底部,并通過過濾海水以浮游生物為食。在南極洲周圍水域中的小殖民地生長的金黃色葡萄球菌含有一種名為“ Palmerolide A”的生物活性化合物,具有抗黑素瘤的特性-研究人員認為,該化合物是由與阿拉伯鏈霉菌。

在本月發(fā)表在《海洋藥物》雜志上的一篇新論文中,Murray和來自南佛羅里達大學,洛斯阿拉莫斯國家實驗室以及法國南特大學的合作者提出了重要的新發(fā)現(xiàn),這些發(fā)現(xiàn)測量了從南極洲的Anvers采集的樣品中的棕櫚油內(nèi)酯水平。群島群島,并表征組成金黃色葡萄球菌微生物群的細菌群落。

穆雷說:“我們的長期目標是弄清該物種中許多細菌中的哪一種正在產(chǎn)生棕櫚油內(nèi)酯,但是要做到這一點,我們需要了解很多關于金蓮花沙門氏菌的微生物。”“我們的新研究描述了過去幾年中我們在實現(xiàn)該目標方面取得的許多進步。”

2008年,Murray與南佛羅里達大學的Bill Baker博士和DRI博士后研究員Christian Riesenfeld博士合作,發(fā)表了關于單個金絲桃的微生物多樣性的研究。他們的這項新研究建立在這項研究的基礎上,通過表征從安弗斯島周圍收集的63個不同個體的微生物多樣性來表征。

他們的結(jié)果確定了研究人員所說的物種的“核心微生物組”-一套普通的21種細菌分類群存在于80%以上的樣本中,而6種細菌分類群則存在于所有63種樣本中。

穆雷說:“這是南極科學界的關鍵“第一”,因為它能夠在相當大的區(qū)域研究這些生物的過程中找到并鑒定出這一核心微生物組。“這是我們需要進行下一步以確定棕櫚油內(nèi)酯生產(chǎn)者的信息。”

南極科學以及大自然中天然產(chǎn)物研究的另一個“第一”是對所有63個樣品中棕櫚油內(nèi)酯水平的比較,結(jié)果表明該化合物在每個標本中的含量都很高(毫克每克標本組織),但是研究人員沒有發(fā)現(xiàn)站點,樣本或微生物組細菌之間的趨勢。對大型數(shù)據(jù)集上的分類單元的共現(xiàn)關系進行的其他分析顯示了細菌相互相互作用以及與該海洋生態(tài)系統(tǒng)中的宿主物種相互作用的一些方式。

默里說:“微生物組本身在其他海生動物中的組成是獨特的,并且看起來很有趣,并且具有很多相互作用。”“我們的研究為理解該系統(tǒng)的生態(tài)打開了大門。”

從研究人員已經(jīng)鑒定為構(gòu)成金黃色葡萄球菌核心微生物組的細菌的組合中,他們接下來希望使用基因組學方法最終確定哪些細菌在產(chǎn)生棕櫚油內(nèi)酯-這是朝著重要的方向和需要取得的進展黑色素瘤治療的發(fā)展。

默里說:“使用這種化合物開發(fā)抗黑素瘤的藥物將是非常重要的,因為目前只有很少的藥物可用于治療它。”“如果我們能夠識別出產(chǎn)生這種化學物質(zhì)的細菌,并且能夠通過其基因組了解如何在實驗室環(huán)境中進行培養(yǎng),那么這將使我們能夠提供可持續(xù)的棕櫚油內(nèi)酯供應,而這將不依賴于在南極洲采集該物種的野生種群。 ”。

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