1943 年,兩位名叫 Max Delbrück 和 Salvador Luria 的科學(xué)家進(jìn)行了一項(xiàng)實(shí)驗(yàn),證明細(xì)菌可以隨機(jī)突變,獨(dú)立于外部刺激,例如威脅細(xì)菌細(xì)胞生存的抗生素。今天,Luria-Delbrück 實(shí)驗(yàn)在實(shí)驗(yàn)室中被廣泛用于不同的目的——科學(xué)家們使用這個(gè)經(jīng)典實(shí)驗(yàn)來(lái)確定微生物突變率。在進(jìn)行 Luria-Delbrück 實(shí)驗(yàn)時(shí),科學(xué)家需要高效的計(jì)算機(jī)算法來(lái)從數(shù)據(jù)中提取可靠的突變率估計(jì)值,他們還需要精心設(shè)計(jì)的軟件工具來(lái)訪問(wèn)這些復(fù)雜的算法。
多年來(lái),開(kāi)發(fā)了多種網(wǎng)絡(luò)工具,使研究人員能夠更輕松地在計(jì)算機(jī)上輸入和分析數(shù)據(jù),以提高Luria-Delbrück 實(shí)驗(yàn)的效率和功效。然而,沒(méi)有現(xiàn)有的網(wǎng)絡(luò)工具允許科學(xué)家訪問(wèn)許多最近開(kāi)發(fā)的算法,這些算法可以從數(shù)據(jù)中提取更準(zhǔn)確的微生物突變率估計(jì)值。
德州農(nóng)工大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院教授 Qi Zheng 博士最近開(kāi)發(fā)了一種名為 webSalvador 的新網(wǎng)絡(luò)工具,以填補(bǔ)現(xiàn)有網(wǎng)絡(luò)工具留下的幾個(gè)空白。在微生物資源公告 (MRA)期刊中,Zheng 解釋了 WebSalvador 如何提供許多對(duì)細(xì)菌突變研究至關(guān)重要的理想功能,包括構(gòu)建置信區(qū)間的更準(zhǔn)確方法和比較突變率的新方法。
該網(wǎng)絡(luò)工具還消除了科學(xué)家學(xué)習(xí)編程和軟件語(yǔ)言的需要,鄭將其描述為使用 Luria-Delbrück 實(shí)驗(yàn)解決突變研究中的重要問(wèn)題的“重要障礙”,例如全球公共衛(wèi)生頭痛的細(xì)菌藥物抵抗性。
對(duì)于大多數(shù)生物學(xué)家來(lái)說(shuō),學(xué)習(xí)軟件語(yǔ)言既具有挑戰(zhàn)性又耗時(shí)。借助 webSalvador,生物學(xué)家可以輕松輸入數(shù)據(jù)并查看結(jié)果。”
標(biāo)簽: 細(xì)菌突變
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