中國科學(xué)院(CAS)大連化學(xué)物理研究所(DICP)PIAO Hailong教授領(lǐng)導(dǎo)的研究小組通過生物信息學(xué)和機(jī)器學(xué)習(xí)方法鑒定了具有獨(dú)特代謝表型的肝細(xì)胞癌(HCC)亞型，并闡明了其潛力基于代謝物-蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)和多組學(xué)數(shù)據(jù)的機(jī)制。
該研究于 7 月 11日發(fā)表在Advanced Science上，提供了指導(dǎo)精確個(gè)性化 HCC 醫(yī)學(xué)的見解。代謝重編程可以通過調(diào)節(jié)能量和營養(yǎng)代謝促進(jìn)細(xì)胞快速增殖，被認(rèn)為是癌癥的標(biāo)志之一。它可以通過復(fù)雜的代謝物-蛋白質(zhì)相互作用影響其他生物過程。
研究人員利用復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò)和機(jī)器學(xué)習(xí)方法來分析多組學(xué)數(shù)據(jù)和代謝物-蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)，以確定預(yù)后有顯著差異的肝細(xì)胞癌亞型。
他們確定了一種預(yù)后不良的代謝性 HCC 亞型，這與缺氧、代謝酶的高甲基化、各種代謝途徑的下調(diào)和多種脂肪酸的積累密切相關(guān)。此外，許多免疫相關(guān)通路在這種預(yù)后不良的亞型中顯著上調(diào)。
基于對(duì)代謝物-蛋白質(zhì)相互作用的進(jìn)一步分析，研究人員預(yù)測了不飽和脂肪酸與免疫調(diào)節(jié)蛋白之間的多重相互作用，表明不飽和脂肪酸的積累可能是免疫通路上調(diào)的一個(gè)潛在原因。
標(biāo)簽： 肝細(xì)胞癌
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