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研究人員開發(fā)了一個(gè)基于CRISPR的可轉(zhuǎn)移和集成的I型平臺來編輯超級細(xì)菌

導(dǎo)讀 由理學(xué)院分子與細(xì)胞生物學(xué)研究部副教授嚴(yán)愛新博士領(lǐng)導(dǎo)的研究團(tuán)隊(duì),與李嘉誠醫(yī)學(xué)院微生物學(xué)系榮譽(yù)臨床教授胡振宇合作 (HKU) 報(bào)告了一個(gè)可

由理學(xué)院分子與細(xì)胞生物學(xué)研究部副教授嚴(yán)愛新博士領(lǐng)導(dǎo)的研究團(tuán)隊(duì),與李嘉誠醫(yī)學(xué)院微生物學(xué)系榮譽(yù)臨床教授胡振宇合作 (HKU) 報(bào)告了一個(gè)可轉(zhuǎn)移和綜合的 I 型 CRISPR 平臺的開發(fā),該平臺可以有效地編輯銅綠假單胞菌的不同臨床分離株,銅綠假單胞菌是一種能夠感染各種組織和器官的超級細(xì)菌,也是醫(yī)院感染的主要來源。

該技術(shù)可以加速多重耐藥 (MDR) 病原體耐藥決定因素的識別和新型抗耐藥策略的開發(fā)。

該研究開辟了一條新的途徑來對那些野生細(xì)菌物種和分離株進(jìn)行基因組編輯,例如具有臨床和環(huán)境意義的那些以及形成人類微生物組的那些。它還提供了一個(gè)框架來利用原核基因組中廣泛存在的其他 CRISPR-Cas 系統(tǒng)并擴(kuò)展基于 CRISPR 的工具包。該研究已發(fā)表在領(lǐng)先的科學(xué)期刊Nucleic Acids Research 上。

背景

CRISPR-Cas 系統(tǒng)包含原核生物中的適應(yīng)性免疫系統(tǒng),它通過切割病毒的 DNA 來解除入侵病毒的武裝。由于其獨(dú)特的靶向和改變 DNA 序列的能力,CRISPR-Cas 已被用作下一代基因組編輯方法。

該方法基于 2 類 II 型 CRISPR/Cas9 系統(tǒng),該系統(tǒng)徹底改變了大量生物的遺傳學(xué)和生物醫(yī)學(xué)研究,并獲得了 2020 年諾貝爾化學(xué)獎。然而,第 2 類 CRISPR-Cas 系統(tǒng)僅占原核生物中自然編碼的 CRISPR-Cas 系統(tǒng)的約 10%。它們在編輯細(xì)菌基因組方面的應(yīng)用相當(dāng)有限。

值得注意的是,屬于不同類別和類型的 CRISPR-Cas 系統(tǒng)不斷被識別,它們作為擴(kuò)展基于 CRISPR 的工具包的深水庫。最多樣化和分布最廣的 CRISPR-Cas 系統(tǒng)是 I 型系統(tǒng),它占已識別的所有 CRISPR-Cas 系統(tǒng)的 50%,并且有可能擴(kuò)展基于 CRISPR 的工具包,并具有 2 類系統(tǒng)無法獲得的獨(dú)特優(yōu)勢,例如高特異性、最小的脫靶和大片段缺失能力。

然而,I 型 CRISPR-Cas 系統(tǒng)依賴于稱為 Cascade 的多組分效應(yīng)復(fù)合物來干擾 DNA,該 DNA 不易轉(zhuǎn)移到異源宿主,阻礙了這些天然豐富的 CRISPR 在基因組編輯和治療中的廣泛應(yīng)用。

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