流入血液的無(wú)細(xì)胞 DNA (cfDNA) 是在 1940 年代后期發(fā)現(xiàn)的，但隨著基因組學(xué)和計(jì)算分析在過(guò)去幾年的快速發(fā)展，喬治敦倫巴第綜合癌癥中心的研究人員現(xiàn)在認(rèn)為，研究標(biāo)簽或?qū)ζ溥M(jìn)行修改DNA 類(lèi)型，可能有助于更好地了解如何評(píng)估和可能調(diào)節(jié)癌癥和其他疾病的治療方法。他們的觀點(diǎn)來(lái)自對(duì)迄今為止的研究回顧，發(fā)表在 7 月 27 日的遺傳學(xué)前沿。
在細(xì)胞死亡過(guò)程中，這是組織再生的正常部分，cfDNA 從組織中脫落。脫落的 cfDNA 可以從血液樣本中分離出來(lái)，從而提供正常細(xì)胞和癌細(xì)胞中整個(gè)身體的細(xì)胞死亡讀數(shù)，而無(wú)需進(jìn)行侵入性活檢樣本。
“進(jìn)行腫瘤組織活檢是一個(gè)偶然的過(guò)程，通常不能很好地代表整個(gè)腫瘤或其擴(kuò)散，”喬治敦隆巴迪大學(xué)腫瘤學(xué)和藥理學(xué)教授、醫(yī)學(xué)博士、醫(yī)學(xué)博士 Anton Wellstein 說(shuō)。本文。“另一方面，使用血液或液體活檢可提供從所有類(lèi)型細(xì)胞中脫落的 cfDNA 的均質(zhì)表示。”
科學(xué)家們指出，DNA 的短片段和這些片段的化學(xué)修飾(稱為甲基)有助于告訴研究人員相應(yīng)的 DNA 片段來(lái)自哪種細(xì)胞類(lèi)型，因?yàn)檫@些甲基化模式是特定細(xì)胞類(lèi)型所獨(dú)有的。通過(guò)使用 cfDNA 將不同形式的治療對(duì)細(xì)胞的損傷與來(lái)自同一組織的未受損正常細(xì)胞進(jìn)行比較，研究人員可以分析關(guān)于組織中的細(xì)胞如何受到治療和其他外力影響的數(shù)據(jù)寶庫(kù)。這些知識(shí)可能是評(píng)估治療是否有效以及可能導(dǎo)致哪些不良反應(yīng)的關(guān)鍵。
“微調(diào) cfDNA 分析的這些應(yīng)用具有挑戰(zhàn)性，需要深入的方法，無(wú)論是在基因組測(cè)序水平還是在計(jì)算上，”醫(yī)學(xué)博士/博士 Megan Barefoot 解釋說(shuō)。癌癥中心威爾斯坦實(shí)驗(yàn)室的學(xué)生，文章的主要作者。“甲基化 cfDNA 開(kāi)辟了一種新的微創(chuàng)方法來(lái)檢測(cè)體內(nèi)細(xì)胞的損傷，因?yàn)槊總€(gè)細(xì)胞通常有數(shù)百個(gè)甲基標(biāo)記物可以非常具體地標(biāo)記細(xì)胞的來(lái)源，就像雜貨店的條形碼掃描儀結(jié)賬告訴商店特定產(chǎn)品的身份。結(jié)合生物學(xué)和計(jì)算分析使破譯這些甲基化模式/分子條形碼成為可能，以便研究人員可以追蹤 cfDNA 的起源。”
例如，這些分析的最終結(jié)果有助于研究人員確定癌癥的起源組織，并且還允許研究人員在將受損細(xì)胞與健康細(xì)胞進(jìn)行比較時(shí)了解損傷的來(lái)源，尤其是如果它是由于某種原因造成的。治療類(lèi)型。
“這種方法可以應(yīng)用于任何會(huì)通過(guò)導(dǎo)致組織中的細(xì)胞受損和死亡而影響組織平衡的療法，包括化學(xué)療法、放射療法和免疫療法。這項(xiàng)審查確實(shí)有助于為我們未來(lái)的研究工作奠定基礎(chǔ)，”威爾斯坦總結(jié)道。“我的實(shí)驗(yàn)室非常積極地尋求進(jìn)一步完善甲基化 cfDNA 分析的方法和技術(shù)。我們相信這些努力是負(fù)擔(dān)得起的，并且很快將成為實(shí)驗(yàn)室的標(biāo)準(zhǔn)，它們應(yīng)該在促進(jìn)對(duì)許多癌癥的理解和治療方面發(fā)揮作用。”
標(biāo)簽： DNA標(biāo)簽
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