人類腸道微生物組是一個(gè)由數(shù)萬億微生物組成的復(fù)雜社區(qū),這些微生物不斷與彼此和我們的身體相互作用。它支持我們的健康、免疫系統(tǒng)和心理健康——但它是如何維持的?
英國和德國的研究人員與其他國際合作者一道,研究了人類腸道微生物組中細(xì)菌的進(jìn)化——詢問這些微生物如何在其一生中持續(xù)存在——同時(shí)考慮了內(nèi)部和外部影響因素。
該研究的結(jié)果將有助于為定制的益生菌、特定食物或補(bǔ)充劑中發(fā)現(xiàn)的活細(xì)菌以及飲食或醫(yī)學(xué)干預(yù)提供信息,以治療腸道疾病并維持健康的腸道微生物群。
保持穩(wěn)定、健康的腸道微生物群對我們和細(xì)菌都有利。為了換取營養(yǎng)和舒適的棲息地,微生物群落通過為我們提供健康益處來回報(bào)我們,我們現(xiàn)在開始了解這一點(diǎn)。
來自 Quadram 研究所和厄勒姆研究所的主要作者和小組負(fù)責(zé)人 Falk Hildebrand 博士解釋說:“我們知道某些微生物在我們出生時(shí)就定植在我們身上,有些可以與我們一起生活幾十年。然而,盡管研究已經(jīng)研究了單個(gè)微生物物種,但尚未探索整個(gè)微生物組中持久性的機(jī)制和規(guī)模。”
為了檢驗(yàn)這一點(diǎn),位于諾里奇研究園的厄勒姆研究所和 Quadram 研究所的一組科學(xué)家以及德國的歐洲分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室 (EMBL) 使用宏基因組學(xué)來分析人類腸道中不同細(xì)菌的進(jìn)化策略和持久性微生物組。
宏基因組學(xué)是對來自人群中許多不同生物的所有基因的研究。就人類腸道微生物組而言,該過程不僅提供了有關(guān)現(xiàn)有細(xì)菌菌株的詳細(xì)信息,而且還表明這些不同菌株根據(jù)其遺傳學(xué)增強(qiáng)了保持腸道良好工作狀態(tài)的能力。
通過分析糞便樣本,該團(tuán)隊(duì)重新檢查了 2,000 多個(gè)成人和嬰兒樣本的宏基因組,其中包括來自同一家族的幾個(gè)樣本,并發(fā)現(xiàn)了人類腸道細(xì)菌持久性的三種主要傳播策略。數(shù)據(jù)來自之前發(fā)表的研究,研究微生物組隨時(shí)間的變化,每個(gè)人平均間隔幾個(gè)月提供 2-3 個(gè)樣本。
最后一位作者兼主任 EMBL 海德堡(科學(xué)活動(dòng))Peer Bork 教授說:“通過研究個(gè)人和家庭成員的時(shí)間序列,并將其與地理信息疊加,從家庭到城市到國家,我們確定了顯示不同的傳播策略。這在宿主、區(qū)域傳播和數(shù)百種細(xì)菌的地理分布中呈現(xiàn)出非常不同的持久性模式。”
這些數(shù)據(jù)被構(gòu)建到一個(gè)包含 5,278 個(gè)宏基因組的多樣化數(shù)據(jù)集中,用于分析不同類型細(xì)菌的持久性模式以及這些模式如何受到共同因素的影響:年齡、家庭成員、地理區(qū)域和抗生素使用。
Hildebrand 博士說:“我們的分析表明,微生物組中存在的大多數(shù)細(xì)菌菌株都非常持久——一種菌株至少持續(xù)一年的可能性超過 90%。”
標(biāo)簽: 人類腸道微生物組
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