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新研究描繪了蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域的進(jìn)化歷史和相互關(guān)系

導(dǎo)讀 自 大流行開始以來,蛋白質(zhì)一直在悄悄地接管我們的生活。我們一直生活在病毒所謂的尖峰蛋白的心血來潮中,這種蛋白已經(jīng)發(fā)生了數(shù)十次突變

自 大流行開始以來,蛋白質(zhì)一直在悄悄地接管我們的生活。我們一直生活在病毒所謂的“尖峰”蛋白的心血來潮中,這種蛋白已經(jīng)發(fā)生了數(shù)十次突變以產(chǎn)生越來越致命的變種。但事實(shí)是,我們一直被蛋白質(zhì)統(tǒng)治。在細(xì)胞層面,它們幾乎負(fù)責(zé)一切。

蛋白質(zhì)是如此重要,以至于 DNA——使我們每個(gè)人都獨(dú)一無二的遺傳物質(zhì)——本質(zhì)上只是一長(zhǎng)串蛋白質(zhì)藍(lán)圖。對(duì)于動(dòng)物、植物、真菌、細(xì)菌、古細(xì)菌,甚至病毒來說都是如此。正如這些生物群會(huì)隨著時(shí)間的推移而進(jìn)化和變化一樣,蛋白質(zhì)及其組成部分也是如此。

伊利諾伊大學(xué)研究人員發(fā)表在《科學(xué)報(bào)告》上的一項(xiàng)新研究描繪了 38 億年來蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域(蛋白質(zhì)分子的亞基)的進(jìn)化歷史和相互關(guān)系。

了解在進(jìn)化過程中結(jié)構(gòu)域如何以及為什么在蛋白質(zhì)中結(jié)合可以幫助科學(xué)家理解和設(shè)計(jì)蛋白質(zhì)在醫(yī)學(xué)和生物工程應(yīng)用中的活性。例如,這些見解可以指導(dǎo)疾病管理,例如利用 病毒的刺突蛋白制造更好的疫苗。”

Gustavo Caetano-Anollés,研究高級(jí)作者和作物科學(xué)系教授

Caetano-Anollé 還是伊利諾伊州 Carl R. Woese 基因組生物學(xué)研究所的附屬機(jī)構(gòu)。

自大流行初期以來,Caetano-Anollés 一直在研究 COVID 突變的演變,但該時(shí)間表僅代表了他和博士生 Fayez Aziz 在當(dāng)前研究中所研究的極少一部分。

研究人員編譯了所有分類群(包括高等生物和微生物)的數(shù)百個(gè)基因組中編碼的數(shù)百萬個(gè)蛋白質(zhì)序列的序列和結(jié)構(gòu)。他們不關(guān)注整個(gè)蛋白質(zhì),而是關(guān)注結(jié)構(gòu)域。

“大多數(shù)蛋白質(zhì)由多個(gè)域組成。這些是具有特殊功能的緊湊結(jié)構(gòu)單元或模塊,”Caetano-Anollés 說。“更重要的是,它們是進(jìn)化的單位。”

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