由貝勒醫(yī)學(xué)院研究人員領(lǐng)導(dǎo)的一個(gè)團(tuán)隊(duì)報(bào)告說(shuō),一種分析基因組區(qū)域的創(chuàng)新策略為精神分裂癥的早期診斷提供了可能性。該策略應(yīng)用了一種稱為 SPLS-DA 的機(jī)器學(xué)習(xí)算法來(lái)分析稱為 CoRSIVs 的人類基因組的特定區(qū)域,希望能夠揭示該病癥的表觀遺傳標(biāo)記。
在來(lái)自血液樣本的DNA中,該團(tuán)隊(duì)確定了表觀遺傳標(biāo)記,即 DNA 中甲基化學(xué)基團(tuán)的特征,在被診斷患有精神分裂癥的人和沒(méi)有這種疾病的人之間存在差異,并開發(fā)了一個(gè)模型來(lái)評(píng)估個(gè)人患病的可能性。在獨(dú)立數(shù)據(jù)集上測(cè)試該模型表明,它可以以 80% 的準(zhǔn)確率識(shí)別精神分裂癥患者。該研究發(fā)表在《轉(zhuǎn)化精神病學(xué)》雜志上。
“精神分裂癥是一種毀滅性的疾病,影響著世界上大約 1% 的人口,”通訊作者羅伯特 A.沃特蘭博士說(shuō),他是貝勒美國(guó)農(nóng)業(yè)部/美國(guó)農(nóng)業(yè)部?jī)和癄I(yíng)養(yǎng)研究中心的兒科營(yíng)養(yǎng)學(xué)教授,以及分子和人類遺傳學(xué)教授。“雖然遺傳和環(huán)境因素似乎與這種情況有關(guān),但目前的證據(jù)只能解釋一小部分病例,這表明其他因素,如表觀遺傳,也可能很重要。”
表觀遺傳學(xué)是一種對(duì) DNA 進(jìn)行分子標(biāo)記的系統(tǒng)——它告訴身體中的不同細(xì)胞在該細(xì)胞類型中打開或關(guān)閉哪些基因,因此表觀遺傳標(biāo)記可以在一個(gè)人的不同正常組織之間變化。這使得評(píng)估表觀遺傳變化是否會(huì)導(dǎo)致涉及大腦的疾病(如精神分裂癥)變得具有挑戰(zhàn)性。
為了解決這個(gè)障礙,Waterland 和他的同事在之前的工作中確定了一組特定的基因組區(qū)域,其中 DNA 甲基化是一種常見(jiàn)的表觀遺傳標(biāo)記,在人與人之間不同,但在一個(gè)人的不同組織中是一致的。他們將這些基因組區(qū)域稱為 CoRSIV,用于表示系統(tǒng)個(gè)體間變異的相關(guān)區(qū)域。他們提出研究 CoRSIV 是一種揭示疾病表觀遺傳原因的新方法。
“因?yàn)?CoRSIV 中的甲基化模式在一個(gè)人的所有組織中都是相同的,我們可以在血液樣本中對(duì)其進(jìn)行分析,以推斷對(duì)身體其他難以評(píng)估的部位(例如大腦)的表觀遺傳調(diào)控,”沃特蘭說(shuō)。
研究人員解釋說(shuō),許多先前的研究分析了血液樣本中的甲基化譜,目的是確定精神分裂癥患者之間的表觀遺傳差異。
標(biāo)簽: 精神分裂癥
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