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來自真菌的酶顯示分子的轉(zhuǎn)向方式

導(dǎo)讀 休斯頓 -(2021 年 7 月 6 日)- 萊斯大學(xué)的科學(xué)家表示,一種小型真菌酶可以在簡化藥物的開發(fā)和制造方面發(fā)揮重要作用。萊斯化學(xué)和生物

休斯頓 -(2021 年 7 月 6 日)- 萊斯大學(xué)的科學(xué)家表示,一種小型真菌酶可以在簡化藥物的開發(fā)和制造方面發(fā)揮重要作用。

萊斯化學(xué)和生物分子工程師 Xue Sherry Gao 實驗室及其合作者在鑒定出一種稱為 CtdE 的生物催化劑是控制原生真菌宿主產(chǎn)生的化合物的手性(左旋或右旋)的自然機制后,分離出了一種生物催化劑。

開放獲取研究發(fā)表在Nature Communications 上。

兩個手性的東西,就像手一樣,結(jié)構(gòu)相似,但不能完全重疊。Gao 說,由于該特性對于設(shè)計與其靶標(biāo)正確結(jié)合的藥物很重要,因此非常需要實現(xiàn) 100% 正確手性的能力。

“這很重要,因為如果藥物具有錯誤的立體化學(xué)(三維手性),即使平面化學(xué)結(jié)構(gòu)相同,它也可能成為人類的毒藥,”她說。

高說,就像手性物體中的“左”或“右”取向一樣,所謂的 3S 或 3R 取向是由分子的立體中心決定的,即分子各部分之間的單原子連接。

但是,雖然大自然可以輕松處理這個過程,但選擇性合成立體中心對化學(xué)家來說是一個挑戰(zhàn)。直到現(xiàn)在,自然界控制分子是否具有 3S 或 3R 取向的能力背后的整個機制一直被隱藏起來。

了解它在真菌中的作用并分析其結(jié)構(gòu)可以為科學(xué)家,尤其是那些設(shè)計藥物的科學(xué)家提供一種新的化學(xué)合成工具。

該研究的重點是一種被稱為 21R-citrinadin A 的生物活性天然產(chǎn)物,它于 2004 年在柑橘青霉的海洋衍生真菌菌株中發(fā)現(xiàn),對小鼠的白血病和人類肺癌細(xì)胞具有毒性。

“21R-citrinadin A 是一種非常復(fù)雜的分子,有八個立體中心,”高說。“在某種程度上,這篇論文強調(diào)了大自然如何使用酶以如此精確的方式合成復(fù)雜的分子。八個不同的立體中心需要控制很多。”

她說該分子包含一個“非常有趣”的 3S 螺環(huán)吲哚環(huán)。“大自然會產(chǎn)生其他幾種具有類似螺吲哚藥效團的化學(xué)物質(zhì),”高說。“然而,我們非常好奇其中一些含有 3R 螺環(huán)吲哚環(huán),與柑橘苷中的 3S 相反。

“負(fù)責(zé)表達(dá)這種小分子的所有基因都聚集在這些真菌中,所以首先我們找到了基因簇,然后單獨觀察每個基因,看看哪個基因可能對催化特定化學(xué)轉(zhuǎn)化最重要,”她說。

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