弗吉尼亞大學(xué)醫(yī)學(xué)院的科學(xué)家們開發(fā)了重要的新資源，這些資源將有助于抗擊癌癥并推進(jìn)前沿的基因組學(xué)研究。
UVA的Chongzhi Zang博士及其同事和學(xué)生們開發(fā)了一種新的計(jì)算方法，可以根據(jù)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)在三個維度上繪制染色體的折疊模式。這很重要，因?yàn)槿旧w內(nèi)部遺傳物質(zhì)的配置實(shí)際上會影響我們基因的工作方式。在癌癥中，這種配置可能會出錯，因此科學(xué)家們希望了解健康細(xì)胞和癌細(xì)胞的基因組結(jié)構(gòu)。除了推進(jìn)醫(yī)學(xué)研究的許多其他領(lǐng)域之外，這將幫助他們開發(fā)更好的方法來治療和預(yù)防癌癥。
Zang及其同事和學(xué)生已經(jīng)使用他們的新方法發(fā)掘了有用數(shù)據(jù)的寶庫，并且正在將其技術(shù)和發(fā)現(xiàn)提供給他們的同行科學(xué)家。為了推進(jìn)癌癥研究，他們甚至建立了一個交互式網(wǎng)站，將他們的發(fā)現(xiàn)與來自其他資源的大量數(shù)據(jù)結(jié)合在一起。他們說，他們的新網(wǎng)站bartcancer.org可以為癌癥研究人員提供“獨(dú)特見解”。
UVA公共衛(wèi)生中心的計(jì)算生物學(xué)家Zang說：“基因組的折疊模式具有很高的動態(tài)性;它的變化頻繁，并且在細(xì)胞之間也有所不同。我們的新方法旨在將這種動態(tài)模式與基因活性的控制聯(lián)系起來。”基因組學(xué)和UVA癌癥中心。“更好地了解這一聯(lián)系可以幫助闡明癌癥和其他疾病的遺傳原因，并可以指導(dǎo)精密醫(yī)學(xué)的未來藥物開發(fā)。”
在BART上下注
Zang繪制基因組折疊圖的新方法稱為BART3D。從本質(zhì)上講，它會將有關(guān)一個染色體區(qū)域的可用三維結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)與許多鄰近區(qū)域進(jìn)行比較。然后，可以使用這種比較方法推斷出這些結(jié)果，使用他們最近開發(fā)的一種新穎算法“結(jié)合轉(zhuǎn)錄調(diào)控的結(jié)合分析”或BART來填補(bǔ)遺傳物質(zhì)藍(lán)圖中的空白。結(jié)果是一張圖譜，為我們的基因如何與控制其活性的“轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子”相互作用提供了前所未有的見識。識別這些調(diào)節(jié)劑有助于科學(xué)家了解打開和關(guān)閉特定基因的原因-它們可用于抗擊癌癥和其他疾病的信息。
標(biāo)簽： 抗癌
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