根據(jù)國(guó)際研究聯(lián)盟的一項(xiàng)新研究，每個(gè)城市都有自己獨(dú)特的微生物組，即獨(dú)特識(shí)別病毒和細(xì)菌的“指紋”，該研究組包括馬里蘭大學(xué)醫(yī)學(xué)院(UMSOM)的一個(gè)團(tuán)隊(duì)。這個(gè)國(guó)際項(xiàng)目對(duì)從全球60個(gè)城市的公共交通系統(tǒng)和醫(yī)院收集的樣本進(jìn)行了測(cè)序和分析，今天發(fā)表在《細(xì)胞》雜志上。
該研究被認(rèn)為是有史以來全球最大的城市微生物群宏研究，涵蓋多個(gè)城市的空氣和地表。它具有對(duì)所有鑒定出的微生物種類的全面分析-包括數(shù)千種病毒和細(xì)菌以及參考數(shù)據(jù)庫中找不到的兩種新近鑒定出的單細(xì)胞生物。
研究合著者Lynn Schriml，博士，UMSOM基因組科學(xué)研究所(IGS)流行病學(xué)與公共衛(wèi)生學(xué)系副教授，領(lǐng)導(dǎo)了巴爾的摩過境系統(tǒng)的研究抽樣工作。她說：“巴爾的摩獨(dú)特的微生物特征揭示了一個(gè)獨(dú)特的，令人著迷的，多樣化的世界，提供了對(duì)地理變異和以前未知的微生物基因組的見解。”
研究高級(jí)作者克里斯托弗·梅森(Christopher Mason)博士，威爾康奈爾大學(xué)(Will Cornell Medicine)教授，世界定量預(yù)測(cè)倡議組織(WorldQuant Initiative for Quantitative Prediction)的負(fù)責(zé)人補(bǔ)充道：“每個(gè)城市都有定義其微生物的'分子回聲'。如果您給我穿上鞋子，我可以以大約90%的準(zhǔn)確率告訴您您所來自的世界城市。”
該研究是在大流行關(guān)閉世界各地的城市之前進(jìn)行的，因此研究人員現(xiàn)在正在研究大流行如何影響每個(gè)城市的微生物組指紋。施里默說：“這是一個(gè)很好的問題，我們將在后續(xù)研究中解決這個(gè)問題。”該聯(lián)盟于2020年啟動(dòng)了MetaCOV項(xiàng)目，以調(diào)查城市元基因組的變化，并分離出SARS-CoV-2病毒(引起的病毒)在城市環(huán)境(例如ATM機(jī)，廢水，醫(yī)院，公交系統(tǒng))中的存在)。
最新研究的結(jié)果是基于對(duì)過去三年來對(duì)六大洲城市的4,728個(gè)樣本進(jìn)行的分析得出的，這些樣本代表了全球第一個(gè)系統(tǒng)的城市微生物生態(tài)系統(tǒng)目錄。除了在各個(gè)城市中具有明顯的微生物特征外，分析還揭示了一組核心的31種物種，這些物種在整個(gè)采樣城市地區(qū)的97%的采樣中都被發(fā)現(xiàn)。研究人員確定了4,246種已知的城市微生物，但他們還發(fā)現(xiàn)，任何后續(xù)采樣仍可能會(huì)繼續(xù)發(fā)現(xiàn)以前從未見過的物種，這凸顯了與等待城市環(huán)境中的微生物多樣性和生物功能有關(guān)的發(fā)現(xiàn)的潛在潛力。 。
將來，該發(fā)現(xiàn)還具有許多潛在的實(shí)際應(yīng)用，包括確定可用作抗生素的潛在新化合物以及由生物合成基因簇(BGC)注釋的具有開發(fā)藥物前景的小分子。
標(biāo)簽： 細(xì)菌微生物
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