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基于人工智能的設(shè)計(jì)方法合成模擬血漿的聚合物

導(dǎo)讀 地球上的大多數(shù)生命都是基于 20 種氨基酸的聚合物,這些氨基酸已經(jīng)進(jìn)化成數(shù)十萬種不同的、高度專業(yè)化的蛋白質(zhì)。它們催化反應(yīng),形成脊柱和

地球上的大多數(shù)生命都是基于 20 種氨基酸的聚合物,這些氨基酸已經(jīng)進(jìn)化成數(shù)十萬種不同的、高度專業(yè)化的蛋白質(zhì)。它們催化反應(yīng),形成脊柱和肌肉,甚至產(chǎn)生運(yùn)動(dòng)。

但所有這些多樣性都是必要的嗎?生物學(xué)可以用更少的構(gòu)建塊和更簡(jiǎn)單的聚合物同樣有效嗎?

加州大學(xué)伯克利分校的聚合物科學(xué)家 Ting Xu 這樣認(rèn)為。她開發(fā)了一種方法,僅使用兩種、四種或六種不同的構(gòu)建塊來模擬天然蛋白質(zhì)的特定功能;目前用于塑料的那些 -;并發(fā)現(xiàn)這些替代聚合物與真正的蛋白質(zhì)一樣有效,并且比試圖復(fù)制大自然的設(shè)計(jì)更容易合成。

作為概念驗(yàn)證,她使用基于機(jī)器學(xué)習(xí)或人工智能的設(shè)計(jì)方法來合成模擬血漿的聚合物。人造生物液在不冷藏的情況下保持天然蛋白質(zhì)生物標(biāo)志物完好無損,甚至使天然蛋白質(zhì)更耐高溫——;比真正的血漿有所改進(jìn)。

蛋白質(zhì)替代品或隨機(jī)雜聚物 (RHP) 可能會(huì)改變生物醫(yī)學(xué)應(yīng)用的游戲規(guī)則,因?yàn)楫?dāng)今的許多努力都在調(diào)整天然蛋白質(zhì)以完成它們最初設(shè)計(jì)無法完成的事情,或試圖重建 3D天然蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)。模擬天然人類蛋白質(zhì)的小分子藥物遞送是一個(gè)熱門研究領(lǐng)域。

相反,人工智能可以選擇正確數(shù)量、類型和排列的塑料積木——;類似于牙科填充物中使用的那些,例如 -;為了模擬蛋白質(zhì)的所需功能,可以使用簡(jiǎn)單的聚合物化學(xué)來制造它。

例如,在血漿的情況下,人造聚合物被設(shè)計(jì)用來溶解和穩(wěn)定血液中的天然蛋白質(zhì)生物標(biāo)志物。徐和她的團(tuán)隊(duì)還創(chuàng)造了一種合成聚合物的混合物來代替細(xì)胞的內(nèi)臟,即所謂的胞質(zhì)溶膠。在一個(gè)裝滿人造生物液體的試管中,細(xì)胞的納米機(jī)器,即核糖體,繼續(xù)泵出天然蛋白質(zhì),好像它們并不關(guān)心液體是天然的還是人造的。

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