近年來,計算病理學(xué)領(lǐng)域取得了快速進(jìn)展,這是指計算方法在病理工作流程中的應(yīng)用。傳統(tǒng)病理學(xué)涉及通過檢查組織、器官和體液來研究疾病。在計算病理學(xué)中,使用計算機算法分析數(shù)字病理圖像以提取有意義的信息。
為此,機器學(xué)習(xí)、圖像分析和數(shù)據(jù)挖掘技術(shù)被用來協(xié)助病理學(xué)家完成疾病診斷和預(yù)后等任務(wù)。數(shù)字病理學(xué)的采用工作流程、這些圖像的大數(shù)據(jù)集的發(fā)布以及計算基礎(chǔ)設(shè)施的改進(jìn)都促進(jìn)了最近的技術(shù)進(jìn)步。
計算病理學(xué)中的方法可以大致分為兩個目標(biāo)。首先,常規(guī)工作流程的自動化,否則將由病理學(xué)家執(zhí)行,其次是增加新功能。
菲利普·韋茨博士在他的論文中醫(yī)學(xué)流行病學(xué)和生物統(tǒng)計學(xué)系的學(xué)生,專注于新能力,即新方法的開發(fā)、應(yīng)用和評估,特別是從病理圖像預(yù)測基因表達(dá)以及病理圖像之間的配準(zhǔn)。這有可能提高精確診斷的質(zhì)量和獲取精確診斷的機會。
您的論文中最重要的結(jié)果是什么?
我的論文包括五項研究。其中兩項重點關(guān)注從組織病理學(xué)圖像預(yù)測基因表達(dá)的方法的開發(fā)和評估。在這些研究中,我們發(fā)現(xiàn)共表達(dá)簇中基因表達(dá)的預(yù)測顯著降低了計算成本,同時可能提高預(yù)測性能。此外,我們發(fā)現(xiàn)基于注意力的多實例學(xué)習(xí)似乎并沒有提高基因表達(dá)預(yù)測性能,同時可能更容易受到過度擬合的影響。
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