一組研究人員開發(fā)了一種名為 DANGER(通過 RNA 測序評估的有害和可預(yù)期指南)分析的軟件工具，該工具為所有具有轉(zhuǎn)錄組的生物體中更安全的基因組編輯設(shè)計提供了一種方法。大約十年來，研究人員一直使用 CRISPR 技術(shù)進行基因組編輯。然而，CRISPR的使用也存在一些挑戰(zhàn)。DANGER 分析克服了這些挑戰(zhàn)，使研究人員能夠在沒有參考基因組的情況下進行更安全的靶向和脫靶評估。它具有在醫(yī)學(xué)、農(nóng)業(yè)和生物研究方面的應(yīng)用潛力。
他們的研究成果于 2023 年 8 月 23 日發(fā)表在《生物信息學(xué)進展》雜志上。
基因組編輯或基因編輯是指允許研究人員改變生物體基因組 DNA 的技術(shù)。借助這些技術(shù)，研究人員可以添加、刪除或改變基因組中的遺傳物質(zhì)。
CRISPR-Cas9是眾所周知的基因編輯技術(shù)。它因比其他類似技術(shù)更準確、更快且更便宜而享有盛譽。然而，使用 CRISPR 技術(shù)進行基因編輯面臨著一些挑戰(zhàn)。第一個挑戰(zhàn)是意外的 CRISPR 動力學(xué)引起的表型或可觀察的效應(yīng)沒有得到定量監(jiān)測。
第二個挑戰(zhàn)是CRISPR技術(shù)通常依賴于基礎(chǔ)基因組數(shù)據(jù)，包括參考基因組。參考基因組就像一個模板，為研究人員提供基因組的一般信息。可能會發(fā)生意外的不匹配序列編輯。這些偏離目標的網(wǎng)站總是出乎意料。因此，研究人員需要一種方法來觀察實際的基因組序列并限制潛在的脫靶效應(yīng)。
基因組編輯的設(shè)計需要充分表征的基因組序列。然而，患者、癌癥和未知生物體的基因組信息通常是不完整的。”
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