西奈山轉化疾病模型中心的研究人員發(fā)布了一項開創(chuàng)性的研究,確定了 4,749 個關鍵基因簇(稱為“預后模塊”),它們顯著影響 32 種不同類型癌癥的進展。該研究發(fā)表在《基因組研究》上,作為綜合資源,為開發(fā)下一代癌癥治療和診斷標記物奠定了基礎。
盡管癌癥研究取得了重大進展,但了解該疾病的遺傳復雜性仍然具有挑戰(zhàn)性。先前的研究通常集中于特定癌癥類型中孤立的基因功能。
我們的目標是通過對各種癌癥形式的基因間相互作用進行全面分析來填補這一知識空白。”
Bin 張博士,Willard TC Johnson 神經(jīng)遺傳學研究教授兼西奈山轉化性疾病模型中心主任
該團隊使用多組學方法,將基因組、轉錄組和表觀基因組數(shù)據(jù)納入分析中。他們采用先進的系統(tǒng)生物學方法分析了來自最全面的公共癌癥數(shù)據(jù)庫之一的癌癥基因組圖譜 (TCGA) 的 10,000 多個患者樣本,并使用嚴格的網(wǎng)絡方法來識別和驗證對癌癥有重大影響的基因簇預后。
“我們的發(fā)現(xiàn)意義深遠。我們已經(jīng)鑒定出 4,749 個不同的共同調控基因模塊,它們在癌癥進展中發(fā)揮著關鍵作用,”張博士解釋道。
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