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新技術(shù)提高了冷凍電子顯微鏡的清晰度和安全性

導(dǎo)讀 紐約州伊薩卡市——當(dāng)科學(xué)家需要可視化用來(lái)浸潤(rùn)人體細(xì)胞的刺突蛋白的結(jié)構(gòu)時(shí),他們轉(zhuǎn)向了冷凍電子顯微鏡。作為研究人員武器庫(kù)中最強(qiáng)大的成像

紐約州伊薩卡市——當(dāng)科學(xué)家需要可視化用來(lái)浸潤(rùn)人體細(xì)胞的刺突蛋白的結(jié)構(gòu)時(shí),他們轉(zhuǎn)向了冷凍電子顯微鏡。作為研究人員武器庫(kù)中最強(qiáng)大的成像工具之一,冷凍電子顯微鏡 (cryo-EM) 可以將蛋白質(zhì)、病原體和各種細(xì)胞成分可視化,幾乎可以看到它們的單個(gè)原子。

但是為冷凍電鏡準(zhǔn)備樣品是一個(gè)繁瑣的過(guò)程,它依賴于乙烷——一種強(qiáng)大的液態(tài)冷卻劑,在室溫下是一種容易爆炸的易燃?xì)怏w。

9 月 7 日發(fā)表在國(guó)際晶體學(xué)聯(lián)盟雜志上的一項(xiàng)新研究表明,可以使用更安全、更便宜的冷卻劑——液氮——制備冷凍電鏡樣品,這些樣品可以產(chǎn)生比用乙烷制備的樣品更清晰的圖像。這些發(fā)現(xiàn)顛覆了可追溯到 1980 年代的傳統(tǒng)智慧,并可能提高冷凍電鏡的安全性和質(zhì)量。

“乙烷不是標(biāo)準(zhǔn)的實(shí)驗(yàn)室化學(xué)品。這是危險(xiǎn)的,并利用它增加了額外的復(fù)雜,”資深作者羅伯特·索恩,在藝術(shù)和科學(xué)學(xué)院和韋斯研究員物理學(xué)教授。“液氮是首選的冷卻劑。”

Cryo-EM 的工作原理是通過(guò)在玻璃狀水中閃凍的分子發(fā)射電子,捕捉冰中分子的多個(gè)模糊圖像。復(fù)雜的軟件通常可以將這些模糊的剪輯平均化為一張清晰的 3D 圖像,但并非始終如一。

一些模糊來(lái)自樣本本身。當(dāng)包裹分子的水冷卻得太慢時(shí),它會(huì)形成冰晶,從而降低圖像質(zhì)量??茖W(xué)家們通過(guò)使用乙烷快速冷卻水以使其卡入玻璃狀、無(wú)晶體的薄片來(lái)規(guī)避這個(gè)問(wèn)題。但是如此快速的冷凍會(huì)給位于金薄膜上的紙張帶來(lái)壓力。當(dāng)電子束撞擊紙張時(shí),應(yīng)力會(huì)導(dǎo)致分子移動(dòng),從而以一種稱為電子束誘導(dǎo)運(yùn)動(dòng)的現(xiàn)象來(lái)模糊最終圖像。

“我們有兩個(gè)相反的因素,”索恩說(shuō)。“我們希望快速冷卻樣品,以防止冰晶形成并捕獲分子的生物結(jié)構(gòu)。但我們也希望盡可能緩慢地冷卻樣品,以盡量減少它們?cè)诔上襁^(guò)程中的運(yùn)動(dòng)。”

乙烷可以非??焖俚乩鋮s樣品。但研究人員必須使用液氮將乙烷氣體轉(zhuǎn)化為液體,然后在冷凍后更多的液氮來(lái)儲(chǔ)存樣品。“乙烷很麻煩,很危險(xiǎn),最終,無(wú)論如何,樣品最終都會(huì)在液氮中,”索恩說(shuō)。

根據(jù)過(guò)去 40 年的報(bào)告,液氮的冷卻速度大約比乙烷慢 50 倍,這還不足以將水轉(zhuǎn)化為玻璃狀薄片。但是在 2006 年,Thorne 的研究小組發(fā)現(xiàn)使氮?dú)鉁p速的主要因素是在液體表面上方盤旋的冷氣體,它在小樣品到達(dá)液體之前冷卻了它們。

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