華盛頓特區(qū) - 2021 年 10 月 19 日- 一項(xiàng)新研究為全球不斷增加的人類腸道病毒組添加了許多以前未表征的病毒基因組和基因。該研究發(fā)表在美國(guó)微生物學(xué)會(huì)的開放獲取期刊mSystems 上，將證明有助于研究腸道病毒組在人類健康和疾病中的作用。
“人類腸道病毒組仍未得到充分探索，許多新病毒有待發(fā)現(xiàn)，其中一些可能對(duì)影響人類健康和疾病的過程產(chǎn)生重要影響，”該研究的首席研究員、該研究的教授 Jelle Matthijnssens 博士說。微生物學(xué)、免疫學(xué)和移植系，Rega 研究所，臨床和流行病學(xué)病毒學(xué)部，病毒宏基因組學(xué)實(shí)驗(yàn)室，KU Leuven，Leuven，比利時(shí)。
人類腸道包含一個(gè)復(fù)雜的微生物生態(tài)系統(tǒng)，其中細(xì)菌已被廣泛研究。Matthijnssens 博士說，對(duì)腸道病毒的研究滯后。MicrobLiver 項(xiàng)目的目標(biāo)是了解宿主與人類腸道微生物組之間的相互作用以及腸道-肝臟軸在酒精性和非酒精性脂肪肝疾病早期的作用。“在 MicrobLiver 項(xiàng)目的框架內(nèi)，我們的目標(biāo)是生成病毒基因組目錄，該目錄可用于后續(xù)對(duì)酒精性和非酒精性脂肪性肝病早期人群的研究，”Matthijnssens 博士說。
在這項(xiàng)新研究中，研究人員使用來(lái)自 204 名丹麥?zhǔn)茉囌叩?254 份糞便樣本來(lái)生成丹麥腸道病毒目錄 (DEVoC)。兒科隊(duì)列包括 50 名體重指數(shù) (BMI) 高于第 90個(gè)百分位數(shù)的兒童和青少年(6-18 歲)，以及 50 名年齡和性別匹配的健康對(duì)照。成人隊(duì)列(34-76 歲)包括 52 名酒精相關(guān)肝病患者和 52 名性別、BMI 和年齡匹配的健康對(duì)照。
研究人員使用新型病毒富集技術(shù) (NetoVIR) 協(xié)議從糞便樣本中純化所有病毒顆粒，并使用深度測(cè)序技術(shù)對(duì)其基因組進(jìn)行測(cè)序。(NetoVir 使研究人員能夠?yàn)橄乱淮鷾y(cè)序腸道病毒組學(xué)研究獲得快速、可重復(fù)、高通量的樣品制備方案。)
此外，他們使用先進(jìn)的生物信息學(xué)工具識(shí)別了近 13,000 個(gè)(部分)病毒基因組，其中許多是新的，并且不存在于公共數(shù)據(jù)庫(kù)中。
標(biāo)簽：
免責(zé)聲明：本文由用戶上傳，如有侵權(quán)請(qǐng)聯(lián)系刪除！