迄今為止,CRISPR 酶已被用于一次編輯一種類型的細胞的基因組:例如,它們將基因剪切、刪除或添加到組織或器官內(nèi)的特定類型的細胞中,或添加到一種正在生長的微生物中。在試管中。
現(xiàn)在,加州大學(xué)伯克利分校近 10 年前發(fā)明了 CRISPR-Cas9 基因組編輯技術(shù)的小組找到了一種方法,可以在許多不同物種的群落中同時添加或修改基因,為所謂的“社區(qū)編輯。”
雖然這項技術(shù)仍然只應(yīng)用于實驗室環(huán)境,但它可以用于編輯和跟蹤自然群落中編輯過的微生物,例如腸道或植物根部,成百上千種不同的微生物聚集在一起。當科學(xué)家們談?wù)摶蚋淖兾⑸锓N群時,這種追蹤變得必要:例如,將基因插入腸道微生物中以解決消化問題,或改變作物的微生物環(huán)境以使其對害蟲更具抵抗力。
如果沒有追蹤基因插入的方法——在這種情況下使用條形碼——這種插入的基因可能會出現(xiàn)在任何地方,因為微生物通常會在它們之間共享基因。
加州大學(xué)伯克利分校博士后研究員 Benjamin Rubin 說:“破壞和改變分離微生物中的 DNA 對理解 DNA 的作用至關(guān)重要。”“這項工作有助于將這種基本方法引入微生物群落,這些方法更能代表這些微生物在自然界中的生活和運作方式。”
雖然一次“霰彈槍”編輯多種類型細胞或微生物的能力在當前的工業(yè)規(guī)模系統(tǒng)中可能很有用——例如,用于批量培養(yǎng)細胞的生物反應(yīng)器,但更直接的應(yīng)用可能是作為理解細胞結(jié)構(gòu)的工具復(fù)雜的細菌、古細菌和真菌群落,以及這些不同種群中的基因流動。
“最終,我們可能能夠消除導(dǎo)致腸道細菌疾病的基因,或者通過改造微生物伙伴來提高植物的效率,”博士后研究員 Brady Cress 說。“但很可能,在我們這樣做之前,這種方法將使我們更好地了解微生物在社區(qū)中的功能。”
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