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基因組暗物質(zhì)活動連接帕金森病和精神疾病

多巴胺神經(jīng)元位于中腦,但它們的卷須狀軸突可以分支到更高的皮質(zhì)區(qū)域,影響我們的運動和感覺。新的基因證據(jù)表明,這些特化細胞也可能有深遠的影響,從帕金森病到精神分裂癥。布里格姆婦女醫(yī)院和哈佛醫(yī)學(xué)院的研究人員利用一種叫做激光捕獲RNA seq的新技術(shù),包括激光切割人腦中的多巴胺神經(jīng)元,已經(jīng)在這些腦細胞中編目了7萬多種新的活性元素。他們的發(fā)現(xiàn)發(fā)表在本周的《自然神經(jīng)科學(xué)》上。

醫(yī)學(xué)博士克萊門斯舍爾澤(Clemens Scherzer)說:“我們發(fā)現(xiàn),人類基因組中高達64%的人——其中絕大多數(shù)是‘暗物質(zhì)’,其DNA無法編碼蛋白質(zhì)——在人腦的多巴胺神經(jīng)元中表達。神經(jīng)學(xué)家和基因組學(xué)科學(xué)家,負責(zé)指導(dǎo)APDA高級帕金森病研究中心和領(lǐng)導(dǎo)BWH的精確神經(jīng)病學(xué)項目?!斑@些是人腦中的關(guān)鍵和特化細胞。它們在帕金森病中起作用緩慢,但在精神分裂癥中可能過于活躍?!?

Scherzer的團隊開發(fā)了激光捕獲RNAseq,可以精確分析大腦中的多巴胺神經(jīng)元,并對人類腦細胞進行超深度RNA測序。該團隊從86個死后大腦中提取了超過40,000個多巴胺神經(jīng)元。雖然其他研究小組專注于產(chǎn)生蛋白質(zhì)的信使RNA,但Scherzer和他的同事希望對細胞的總RNA含量進行分類,這需要進一步的研究。

他們總共發(fā)現(xiàn)了71,022個轉(zhuǎn)錄的非編碼元件(所謂的TNEs)。其中許多TNEs(發(fā)音為“teenies”)是活性增強子——充當(dāng)調(diào)節(jié)“開關(guān)”的部位,為大腦中數(shù)十億個神經(jīng)元開啟特殊功能。該團隊發(fā)掘的許多tne都是新奇的,以前從未在大腦中描述過。舍爾澤和同事與英國的合作者合作,在包括斑馬魚在內(nèi)的臨床前模型中測試了幾種腫瘤壞死因子,發(fā)現(xiàn)了許多腫瘤壞死因子在大腦發(fā)育中活躍的證據(jù)。

諧謔和第一作者董先軍博士,同時也是BWH安羅姆尼中心的首席研究員,最初開始研究多巴胺神經(jīng)元,以獲得對帕金森病更深入的了解,但發(fā)現(xiàn)許多與精神分裂癥、成癮等因素相關(guān)的基因變異也豐富了神經(jīng)精神疾病。

舍爾澤說:“這項工作表明,活躍在多巴胺神經(jīng)元中的非編碼RNA是遺傳風(fēng)險、帕金森病和精神疾病之間令人驚訝的聯(lián)系。“基于這種聯(lián)系,我們假設(shè)風(fēng)險變異可能會影響產(chǎn)生多巴胺的腦細胞的基因轉(zhuǎn)化。”

該團隊還制作了一個公開的多巴胺神經(jīng)元RNA含量百科全書,這樣其他研究人員就可以通過webportalhttp://www.humanbraincode.org找到任何具有蛋白質(zhì)編碼或非編碼靶點的帕金森病和精神疾病的生物標志物和治療劑。

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