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多組學方法識別大量與酒精使用障礙相關的候選基因

西奈山伊坎醫(yī)學院的研究人員使用多組學方法發(fā)表了成癮遺傳學領域的第一項此類研究,以提供與飲酒和酒精使用障礙(AUD)相關的大量因果候選基因列表.該研究還顯示了酗酒、阿爾茨海默病和其他神經(jīng)退行性疾病之間的潛在聯(lián)系。研究結果于 8 月 20 日發(fā)表在Nature Communications 上。

酒精使用障礙是復雜的、中等遺傳性的精神障礙,與發(fā)病率和死亡率升高有關。雖然之前的研究已經(jīng)確定了與飲酒相關的位點(遺傳區(qū)域),但本研究旨在確定變異體和基因本身。“鑒定全基因組關聯(lián)研究 (GWAS) 位點背后的因果變異和基因對于了解酒精使用障礙的生物學和改善其治療至關重要,”第一和共同通訊作者 Manav Kapoor 說。博士,研究期間西奈山神經(jīng)科學、遺傳學和基因組學助理教授。

為了確定與澳元和每周飲酒量 (DPW) 相關的基因,這是一種用于評估酒精消耗的措施,研究團隊整合了多組學數(shù)據(jù),使用基于孟德爾隨機化的方法對來自腦組織和骨髓的最大可用轉錄組和表觀基因組數(shù)據(jù)進行了整合細胞。使用來自這些組織的數(shù)據(jù),該團隊精細定位了復雜基因座并確定了可能的變異和候選基因,包括與酗酒相關的SPI1和MAPT基因。還發(fā)現(xiàn)SPI1和MAPT與其他精神和神經(jīng)退行性疾病的易感性有關,包括抑郁癥和阿爾茨海默病。

SPI1(Spi-1 Proto-Oncogene) 編碼 ETS 域轉錄因子 (PU.1),可在髓樣和 B 淋巴樣細胞發(fā)育和體內平衡過程中調節(jié)基因表達。鑒于SPI1控制了幾個下游基因的表達,正如在過去對人類和動物大腦的轉錄組學分析中所觀察到的那樣,該基因可能是在飲酒行為中豐富免疫途徑的一個主要原因。

研究中分析的MAPT基因編碼 tau 蛋白,該蛋白以其在中樞神經(jīng)系統(tǒng)疾病中的作用而聞名,例如阿爾茨海默病、額顳葉癡呆、帕金森病和其他稱為 tauopathies 的神經(jīng)退行性疾病。

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