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揭開帕金森病基因組學(xué)之謎的進展

導(dǎo)讀 國際帕金森病基因組學(xué)聯(lián)合會 (IPDGC) 現(xiàn)已成立十年。在《帕金森氏病雜志》上發(fā)表的一篇文章中,該聯(lián)盟回顧了過去十年在帕金森氏病 (PD)

國際帕金森病基因組學(xué)聯(lián)合會 (IPDGC) 現(xiàn)已成立十年。在《帕金森氏病雜志》上發(fā)表的一篇文章中,該聯(lián)盟回顧了過去十年在帕金森氏病 (PD) 和相關(guān)疾病(包括路易體病、進行性核上性麻痹和多系統(tǒng)萎縮)的基因組學(xué)方面取得的進展,并展望了其未來發(fā)展未來的方向和研究重點。

自從首次定義 PD 以來,人們一直懷疑存在遺傳成分。2009 年 6 月,一小群研究人員開會討論了一個潛在的專注于 PD 遺傳學(xué)的研究聯(lián)盟。結(jié)果是創(chuàng)建了 IPDGC,這是一個專注于協(xié)作遺傳學(xué)研究的小組,通過信任、共享和“盡可能少的文書工作”實現(xiàn)。本文總結(jié)了 IPDGC 迄今為止所做的工作,并將這些工作置于 PD 基因組學(xué)十年進步的背景下。它還討論了 IPDGC 的未來方向及其在未來十年的既定研究重點。

“IPDGC 的誕生是基于這樣一種認(rèn)識,即沒有一個研究人員能夠孤立地實現(xiàn)現(xiàn)代人類遺傳學(xué)的承諾,”美國國立衛(wèi)生研究院國家衰老研究所神經(jīng)遺傳學(xué)實驗室的主要作者 Andrew Singleton 博士解釋說。 ,美國馬里蘭州貝塞斯達。“我們意識到,要真正大規(guī)模地利用 PD 空間中遺傳技術(shù)取得的令人難以置信的進步,將需要一種高度協(xié)作的方法。這一概念將一小群 PD 遺傳學(xué)家聚集在一起,他們的共同目標(biāo)是建立一個有效、透明和功能協(xié)作。”

自成立以來,IPDGC 發(fā)展迅速,現(xiàn)在包括來自世界各地的 100 多位科學(xué)家,每年至少召開一次會議。重點還擴大到包括大規(guī)模的 PD 臨床和功能研究。最近,IPDGC 在東亞和非洲發(fā)起了重大研究工作,并優(yōu)先考慮與印度和南美洲正在進行的重大工作進行合作。

“全基因組關(guān)聯(lián) (GWA) 數(shù)據(jù)的協(xié)調(diào)分析可能是 IPDGC 的第一個成功,并且一直是我們工作的支柱,”Singleton 博士指出。這項工作集中于來自美國、加拿大、英格蘭、威爾士、荷蘭、法國、德國、意大利、西班牙、奧地利、芬蘭、挪威、愛沙尼亞和澳大利亞的 IPDGC 成員病例和對照隊列的可用全基因組 SNP 基因分型.這些研究涉及 IPDGC 內(nèi)部以及與 Genentech 和 23andMe 等行業(yè)團體的合作。這些樣本系列的來源多樣性和規(guī)模已經(jīng)大大增加,從最初集中在大約 1,500 個病例和類似數(shù)量的對照,到最近的努力包括對 50,000 多個病例和代理病例進行密集基因分型,以及大約 140 萬個控件。與其他疾病一樣,隨著樣本量的增加,功效和檢測到的基因座數(shù)量也在增加。目前,大約有 90 種已知的 PD 風(fēng)險變體。

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