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幫助預測葵花籽油特性的基因分析

來自南加州大學的 Skoltech 研究人員和他們的同事對俄羅斯向日葵系列進行了遺傳分析,并確定了有助于預測油脂肪酸組成的遺傳標記。該研究發(fā)表在BMC Genomics 上。

基因組選擇有助于快速創(chuàng)造新的作物品種,在過去的 10 年里一直是全球討論的熱門話題。DNA 測序和廣泛的基因分型已被應用于獲取作物的遺傳圖譜。當分析并與田間數(shù)據(jù)進行比較時,這些圖譜有助于識別農(nóng)業(yè)感興趣性狀的遺傳標記,并僅根據(jù)其遺傳圖譜預測作物的特性和價值。

“我們的工作是對俄羅斯向日葵基因集合的第一次大規(guī)模研究,也是利用基因組選擇創(chuàng)造新品種的首批嘗試之一。在實際種植之前預測植物會是什么樣子——這個想法直到最近才顯得完全不切實際- 由于技術(shù)進步,在許多國家已經(jīng)變得司空見慣。傳統(tǒng)育種很難應對全球氣候變化、不斷增長的人類需求和不斷變化的食品質(zhì)量要求帶來的挑戰(zhàn)。為了搶占先機,我們應該轉(zhuǎn)向遺傳學,”該研究的主要作者和 Skoltech 博士 Alina Chernova 指出。

這個長期研究項目由 Skoltech 教授 Philipp Khaitovich 領(lǐng)導的聯(lián)合團隊開展,其中包括來自 Skoltech、南加州大學、瓦維洛夫全俄植物遺傳資源研究所和普斯托沃伊特全俄研究所的科學家。油料作物,來自種子生產(chǎn)公司 Agroplasma 的育種者加入。

該團隊研究了來自俄羅斯兩大向日葵基因庫和 Agroplasma 收藏的物種。他們的遺傳分析涵蓋了 601 個栽培向日葵品系,以檢查全球收集的遺傳多樣性,并將結(jié)果與??從這些品系中獲得的油的化學測試進行比較。生物信息學分析揭示了有助于控制油中脂肪酸含量的遺傳標記。

“我們選擇向日葵的原因是它是植物脂肪的主要來源,而俄羅斯是世界領(lǐng)先的向日葵油供應商。您可以改變油的脂肪酸組成——這是我們研究的重點——以獲得含有適合烘烤、調(diào)味或工業(yè)用途的不同特性,”Skoltech 博士生和研究合著者 Rim Gubaev 說。

“由于這個項目,我們獲得了寶貴的見解,并建立了一個志同道合的人團隊,他們熱衷于幫助育種者在他們的工作中引入遺傳學。我們創(chuàng)立了 Oil Gene——這是一家專注于實際任務(wù)并提供基因組選擇的初創(chuàng)公司服務(wù),”Gubaev 補充道。

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