建立HCC預(yù)后circRNA-lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA網(wǎng)絡(luò)。
作者通過單變量、套索和多變量 Cox 回歸分析構(gòu)建了具有 7 個(gè)目標(biāo) mRNA 的預(yù)后特征，其 1、3 和 5 年 AUC 值分別為 0.797、0.733 和 0.721，表明其在 HCC 預(yù)后中的敏感性和特異性.
此外，可以在 GSE14520 中驗(yàn)證預(yù)后特征。根據(jù)7個(gè)hub mRNAs與其他RNAs的靶向關(guān)系，建立了21個(gè)circRNAs、15個(gè)lncRNAs、5個(gè)miRNAs和7個(gè)mRNAs的預(yù)后ceRNA網(wǎng)絡(luò)。
在這項(xiàng) Aging-US 研究中揭示的網(wǎng)絡(luò)可能有助于全面闡明驅(qū)動(dòng) HCC 的 ceRNA 機(jī)制，并為評估 HCC 的預(yù)后提供新的候選生物標(biāo)志物。
慧芳亮博士和碧香張博士無論從科技的華中科技大學(xué)以及肝，胰，膽系疾病的湖北省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室說，“HCC，作為最常見的一種肝癌，已成為一個(gè)癌癥相關(guān)死亡的主要原因，也是引起廣泛關(guān)注的全球健康問題。”
他們描述了一個(gè)復(fù)雜的轉(zhuǎn)錄后調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，其中circRNAs、lncRNAs和其他RNAs可以與miRNAs競爭并通過共享不少于一個(gè)miRNA反應(yīng)元件來充當(dāng)天然的miRNA海綿。
由于這些非編碼 RNA 和蛋白質(zhì)編碼 mRNA 可以通過 MRE 與 miRNA 結(jié)合，因此它們可以與 miRNA 競爭并參與這個(gè)復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)的調(diào)節(jié)。
TCGA 或GEO 數(shù)據(jù)庫的RNA 測序數(shù)據(jù)可以提供各種癌癥的circRNA、miRNA 和mRNA 數(shù)據(jù)，可以成為數(shù)據(jù)挖掘和生物發(fā)現(xiàn)的極好資源。
對于 HCC，預(yù)后 lncRNA-miRNA-mRNA 和 circRNA-miRNA-mRNA ceRNA 網(wǎng)絡(luò)已經(jīng)發(fā)表。
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