建立HCC預后circRNA-lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA網(wǎng)絡(luò)。
作者通過單變量、套索和多變量 Cox 回歸分析構(gòu)建了具有 7 個目標 mRNA 的預后特征,其 1、3 和 5 年 AUC 值分別為 0.797、0.733 和 0.721,表明其在 HCC 預后中的敏感性和特異性.
此外,可以在 GSE14520 中驗證預后特征。根據(jù)7個hub mRNAs與其他RNAs的靶向關(guān)系,建立了21個circRNAs、15個lncRNAs、5個miRNAs和7個mRNAs的預后ceRNA網(wǎng)絡(luò)。
在這項 Aging-US 研究中揭示的網(wǎng)絡(luò)可能有助于全面闡明驅(qū)動 HCC 的 ceRNA 機制,并為評估 HCC 的預后提供新的候選生物標志物。
慧芳亮博士和碧香張博士無論從科技的華中科技大學以及肝,胰,膽系疾病的湖北省重點實驗室說,“HCC,作為最常見的一種肝癌,已成為一個癌癥相關(guān)死亡的主要原因,也是引起廣泛關(guān)注的全球健康問題。”
他們描述了一個復雜的轉(zhuǎn)錄后調(diào)控網(wǎng)絡(luò),其中circRNAs、lncRNAs和其他RNAs可以與miRNAs競爭并通過共享不少于一個miRNA反應(yīng)元件來充當天然的miRNA海綿。
由于這些非編碼 RNA 和蛋白質(zhì)編碼 mRNA 可以通過 MRE 與 miRNA 結(jié)合,因此它們可以與 miRNA 競爭并參與這個復雜網(wǎng)絡(luò)的調(diào)節(jié)。
TCGA 或GEO 數(shù)據(jù)庫的RNA 測序數(shù)據(jù)可以提供各種癌癥的circRNA、miRNA 和mRNA 數(shù)據(jù),可以成為數(shù)據(jù)挖掘和生物發(fā)現(xiàn)的極好資源。
對于 HCC,預后 lncRNA-miRNA-mRNA 和 circRNA-miRNA-mRNA ceRNA 網(wǎng)絡(luò)已經(jīng)發(fā)表。
標簽:
免責聲明:本文由用戶上傳,如有侵權(quán)請聯(lián)系刪除!