世界各地種植的甘薯是重要的營(yíng)養(yǎng)來(lái)源，尤其是在撒哈拉以南非洲和亞洲飲食中。紅薯對(duì)撒哈拉以南非洲地區(qū)尤其重要，因?yàn)樗蔷S生素A的來(lái)源，而維生素A是該地區(qū)通常缺乏的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)。雖然中國(guó)目前是每個(gè)國(guó)家/地區(qū)生產(chǎn)最甜土豆的地區(qū)，但撒哈拉以南非洲有更多的土地種植紅薯，并繼續(xù)擴(kuò)大產(chǎn)量。其他地方的農(nóng)民也越來(lái)越多地種植紅薯。
雖然紅薯很重要，但對(duì)紅薯微生物區(qū)系的了解卻很少。昆蟲(chóng)學(xué)家布魯克比斯辛格解釋說(shuō)：“植物的微生物群會(huì)深刻影響其健康和發(fā)育?！彼罱凇吨参锷锶合惦s志》發(fā)表了一篇關(guān)于甘薯的研究?！拔覀?cè)噲D通過(guò)描述甘薯在實(shí)際工作農(nóng)場(chǎng)和農(nóng)場(chǎng)之間的特性，更好地了解甘薯的微生物群落?！?
Bissinger和他的同事為AgBiome工作，AgBiome是一種由比爾梅林達(dá)蓋茨基金會(huì)資助的生物，旨在識(shí)別和開(kāi)發(fā)有益微生物，保護(hù)發(fā)展中國(guó)家的紅薯免受昆蟲(chóng)侵害。他們利用這個(gè)機(jī)會(huì)來(lái)描述甘薯微生物區(qū)系的特征，以便為他們的項(xiàng)目和其他對(duì)類似工作感興趣的研究人員提供信息。
他們發(fā)現(xiàn)，與更受歡迎的作物相似，甘薯微生物群遵循兩步發(fā)展模式。
“我們已經(jīng)證明了組成單一農(nóng)場(chǎng)的甘薯微生物區(qū)系中微生物的驚人變化。盡管發(fā)生了這種變化，但我們發(fā)現(xiàn)了微生物組在一個(gè)紅薯農(nóng)場(chǎng)和同一地區(qū)的兩個(gè)農(nóng)場(chǎng)的領(lǐng)域中如何發(fā)展的共性，”該論文的主要作者、微生物組數(shù)據(jù)科學(xué)家查爾斯佩佩-蘭尼(Charles Pepe-Ranney)說(shuō)。
這是第一次使用現(xiàn)代下一代測(cè)序技術(shù)來(lái)表征甘薯微生物區(qū)系，這是利用微生物區(qū)系提高甘薯產(chǎn)量的重要第一步。
佩佩-蘭尼說(shuō)：“同樣值得注意的是，我們的研究表明，甘薯對(duì)其內(nèi)生菌(生活在植物中的微生物)構(gòu)成了強(qiáng)大的生態(tài)挑戰(zhàn)。”“比如我們要開(kāi)發(fā)一種能夠保護(hù)紅薯免受害蟲(chóng)侵害的紅薯內(nèi)生菌，這種對(duì)紅薯有益的內(nèi)生菌必須能夠承受紅薯本身強(qiáng)大的生態(tài)壓力?！?
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