保護CRISPR基因驅(qū)動實驗的有效策略

根據(jù)今天發(fā)表在eLife上的一項研究，研究人員首次展示了兩種分子策略如何在實驗室中保護CRISPR基因驅(qū)動的實驗。

他們的研究報告bioRxiv的結果首次表明，科學家可以有效地利用合成靶位點和分裂驅(qū)動進行基因驅(qū)動的研究，而不用擔心在整個自然人群中的意外傳播。

基因驅(qū)動，比如在瘧疾蚊子身上測試的基因驅(qū)動，是一種設計用來在人群中傳播的基因包。他們通過一種叫做“驅(qū)動轉(zhuǎn)化”的過程實現(xiàn)了這個目標，在這個過程中，Cas9酶和一種叫做導向RNA(gRNA)的分子在基因組的某個位置切割。然后在DNA斷裂修復后復制驅(qū)動器。

紐約康奈爾大學生物統(tǒng)計與計算生物學系博士后研究員Jackson Champel解釋說：“基于CRISPR的基因驅(qū)動引起了人們的熱情和深切關注，因為它可能會在基因上改變整個物種?！斑@就提出了一個問題，那就是我們有能力防止這種驅(qū)動因素無意中從實驗室傳播到自然界。

“目前，避免意外傳播的策略涉及對含有駕駛員的生物體進行物理限制。然而，考慮到人為失誤的可能性，目前還不確定這是否足以降低任何意外逃到野外的可能性。”

最近，兩種分子保護策略被提出，它們不僅限制了生物的研究。第一個是由合成靶位點驅(qū)動的，這些靶位點位于野生生物中不存在的工程基因組位點。第二種是切割驅(qū)動的，其中驅(qū)動構建體缺乏一種叫做內(nèi)切核酸酶的酶，但依賴于一種被設計得很遠的酶。

“這些策略的本質(zhì)意味著它們應該防止在各自實驗室線外的有效傳播，”Champer補充道?！拔覀兿胫浪鼈兪欠穸季哂信c標準尋的驅(qū)動器相似的性能，以及它們是否是早期基因驅(qū)動研究的合適替代品?！?

因此，該團隊在果蠅中設計并測試了三種合成靶位點驅(qū)動程序。每個驅(qū)動因子都以基因組中三個不同位點之一引入的增強型綠色熒光蛋白(EGFP)基因為目標。對于分體式驅(qū)動，他們設計了驅(qū)動結構，使得X聯(lián)動底座發(fā)黃，缺少Cas9。

他們的分析表明，帶有合成靶位點的CRISPR基因驅(qū)動程序(如EGFP)表現(xiàn)出與標準驅(qū)動程序相似的行為，因此可以用來替代這些驅(qū)動程序的大多數(shù)測試。拆分驅(qū)動程序顯示出類似的性能，并且當難以使用合成目標時，還允許以自然序列為目標。其中包括需要針對天然基因的群體抑制驅(qū)動因素。

康奈爾大學生物統(tǒng)計與計算生物學系助理教授、資深作者菲利普刀子樂隊說：“根據(jù)我們的研究結果，我們建議在未來基因驅(qū)動的開發(fā)和測試中，應該始終采用這些保護策略?！斑@對于大規(guī)模圈養(yǎng)實驗非常重要，旨在提高我們對候選駕駛員預期種群動態(tài)的理解。最終，這種理解對于討論將成功的驅(qū)動因素釋放到野外的可行性和風險至關重要，例如減少瘧疾和其他病媒傳播的疾病?！?

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