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新的生物信息學(xué)工具可識(shí)別腫瘤細(xì)胞的染色體改變

導(dǎo)讀 巴塞羅那大學(xué)和巴塞羅那生物醫(yī)學(xué)研究所(IRB巴塞羅那)的一個(gè)團(tuán)隊(duì)設(shè)計(jì)了一種新的生物信息學(xué)工具來(lái)識(shí)別癌細(xì)胞特征的染色體改變。這種新的檢測(cè)...

巴塞羅那大學(xué)和巴塞羅那生物醫(yī)學(xué)研究所(IRB巴塞羅那)的一個(gè)團(tuán)隊(duì)設(shè)計(jì)了一種新的生物信息學(xué)工具來(lái)識(shí)別癌細(xì)胞特征的染色體改變。

這種新的檢測(cè)系統(tǒng)被稱為 QATS(生物圖像中環(huán)形核的 QuAntification),是一種計(jì)算生物成像處理工具,通過(guò)其自動(dòng)識(shí)別和量化與腫瘤中染色體不穩(wěn)定性相關(guān)的表型的能力,將有助于改善腫瘤研究和分類。癌細(xì)胞的細(xì)胞核。

這項(xiàng)研究“QATS:用于量化生物圖像中環(huán)形核的 ImageJ 插件”發(fā)表在《生物信息學(xué)》雜志上。

識(shí)別癌細(xì)胞的染色體變化

染色體不穩(wěn)定性在實(shí)體瘤中很常見,它與癌癥的開始和進(jìn)展以及癌細(xì)胞的轉(zhuǎn)移有關(guān)。這種現(xiàn)象是由細(xì)胞分裂過(guò)程中染色體數(shù)量和結(jié)構(gòu)的變化引起的,可以引起 DNA 的變化并影響整個(gè)細(xì)胞機(jī)制。此外,染色體不穩(wěn)定性不僅有利于腫瘤的起源和進(jìn)展,而且還增強(qiáng)了腫瘤內(nèi)的異質(zhì)性和抗腫瘤治療的耐藥性。

癌細(xì)胞可以在高度染色體不穩(wěn)定性的情況下存活。新的 QATS 工具是一個(gè)預(yù)測(cè)系統(tǒng),將有助于識(shí)別和量化生物圖像中的環(huán)形核(染色體不穩(wěn)定性的新生物標(biāo)志物)。

“環(huán)形核在表型上與正常細(xì)胞核不同,因?yàn)樗鼈兂尸F(xiàn)環(huán)形和含有胞質(zhì)物質(zhì)的空隙。在研究領(lǐng)域,它們最近被定性為染色體不穩(wěn)定的重要生物標(biāo)志物,它們代表了理解和理解染色體不穩(wěn)定的創(chuàng)新途徑。對(duì)抗癌癥,”布法羅大學(xué)生物醫(yī)學(xué)系的 Caroline Mauvezin 教授指出。

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