研究DNA重排了解癌癥

基因組的結(jié)構(gòu)變異可能是由于從數(shù)千個(gè)遺傳密碼字母到整個(gè)染色體的基因組片段的刪除、擴(kuò)增或重新排序而產(chǎn)生的。由于這些變體的復(fù)雜機(jī)制，以前很難對(duì)它們進(jìn)行分類。EMBL團(tuán)隊(duì)的負(fù)責(zé)人、泛癌癥項(xiàng)目的發(fā)起人和協(xié)調(diào)人之一簡(jiǎn)科貝爾解釋說(shuō)：“在這項(xiàng)研究中，我們發(fā)現(xiàn)了癌癥基因組重排的不同方法，并對(duì)其進(jìn)行了分類。我們首次對(duì)結(jié)構(gòu)進(jìn)行了詳細(xì)分類，并對(duì)癌癥基因組的變異機(jī)制進(jìn)行了探討?！毖芯咳藛T發(fā)現(xiàn)了幾種可能導(dǎo)致癌癥的新過(guò)程，例如，基因組的某些部分被復(fù)制不止一次的復(fù)雜過(guò)程。這可能會(huì)導(dǎo)致癌癥基因變得活躍，

將事件與突變聯(lián)系起來(lái)。

哥本哈根生物技術(shù)研究和創(chuàng)新中心的負(fù)責(zé)人、EMBL科貝爾研究小組的前博士后研究員約阿希姆韋森費(fèi)爾德說(shuō)：“過(guò)去，大多數(shù)研究都是在編碼1-2%的基因組上進(jìn)行的?！薄敖Y(jié)構(gòu)變異在很大程度上被忽略了，因?yàn)樗鼈兇蠖辔挥诨蚪M的非編碼部分，理解起來(lái)要復(fù)雜得多。”

Weischenfeldt和他的同事開(kāi)發(fā)了一種通過(guò)全基因組測(cè)序分析泛癌數(shù)據(jù)來(lái)識(shí)別結(jié)構(gòu)變異及其形成機(jī)制的方法。Weischenfeldt說(shuō)：“這篇論文是第一批對(duì)癌癥基因組中非常復(fù)雜的結(jié)構(gòu)變異類型進(jìn)行系統(tǒng)分類并將其與形成機(jī)制聯(lián)系起來(lái)的論文之一?！薄八F(xiàn)在使我們能夠區(qū)分癌癥基因組中不同類型的結(jié)構(gòu)變異。我們可以將它們用作不同癌癥的生物標(biāo)志物，因?yàn)橐恍┓浅Ｓ行У尿?qū)動(dòng)基因的突變會(huì)導(dǎo)致特定類型的結(jié)構(gòu)變異?！鄙飿?biāo)記是生物標(biāo)記，如特定的分子或遺傳序列，可用于識(shí)別某些疾病，在這種情況下，是癌癥。

這篇論文讓研究人員更接近于回答一些關(guān)于癌癥的基本問(wèn)題，因?yàn)樗麄儸F(xiàn)在可以探索基因組重排背后的遺傳學(xué)。復(fù)雜的事件可以鏈接回特定的突變，這對(duì)于更好地診斷患者非常重要。該目錄可用于預(yù)后和治療。

一種新的治療工具

Weischenfeldt解釋說(shuō)，這種分析已經(jīng)被用作識(shí)別突變特征的臨床工具。具有特征模式的突變組合。Weischenfeldt目前在哥本哈根生物技術(shù)研究和創(chuàng)新中心工作，正在使用這些分析方法來(lái)了解癌癥患者的遺傳學(xué)，并設(shè)計(jì)更好、更有針對(duì)性的治療方案。他說(shuō)：“我們有一個(gè)程序，使患者能夠根據(jù)基因組發(fā)現(xiàn)獲得準(zhǔn)確的藥物。本文將要發(fā)布的分類方法將成為我們工具箱的重要組成部分?！?

Weischenfeldt解釋說(shuō)，泛癌癥項(xiàng)目訓(xùn)練了他和他的許多同事處理和分析大型和復(fù)雜的數(shù)據(jù)集，以識(shí)別復(fù)發(fā)和生物學(xué)相關(guān)的模式。他說(shuō)：“起初，這些方法并不多。我們必須想出新的、可重復(fù)的研究方法來(lái)分析我們擁有的遺傳信息?！薄斑@是一個(gè)巨大的挑戰(zhàn)，但也是一個(gè)非常激動(dòng)人心的挑戰(zhàn)。這就是我們進(jìn)行研究的原因?！?

科貝爾補(bǔ)充說(shuō)，對(duì)EMBL科學(xué)家來(lái)說(shuō)，跟進(jìn)這篇論文中提出的研究將非常有趣。科貝爾說(shuō)：“對(duì)我們來(lái)說(shuō)，下一步非常重要的是確定所有這些獨(dú)立過(guò)程的分子原因?！?

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