LSTM的研究人員利用生物信息學(xué)方法整合了許多蚊子對(duì)殺蟲(chóng)劑抗性研究的信息，發(fā)現(xiàn)了許多以前沒(méi)有被認(rèn)識(shí)到的重要抗性機(jī)制。
在《自然通訊》上發(fā)表的一項(xiàng)研究中，維多利亞英厄姆博士和她的同事使用專業(yè)的計(jì)算機(jī)編程來(lái)更好地理解蚊子對(duì)當(dāng)前公共衛(wèi)生殺蟲(chóng)劑的抗藥性機(jī)制。她說(shuō)：“在抗擊瘧疾和其他病媒傳播疾病的過(guò)程中，非常重要的一點(diǎn)是，我們能夠充分了解蚊子種群對(duì)殺蟲(chóng)劑的抗藥性。過(guò)去，已經(jīng)對(duì)特定的基因家族進(jìn)行了廣泛的研究。但是，使用數(shù)據(jù)集成的方法，我們已經(jīng)證明還有許多其他機(jī)制在起作用，我們認(rèn)為這些機(jī)制在消除農(nóng)藥方面非常重要?！?
殺蟲(chóng)劑抗藥性是對(duì)全球公共健康的主要威脅，這降低了病媒控制的有效性。目前，它嚴(yán)重依賴殺蟲(chóng)劑制造蚊帳、室內(nèi)殘留物或空中噴灑。耐藥性廣泛存在于主要的疾病媒介中，包括那些傳播瘧疾寄生蟲(chóng)按蚊的媒介。
了解這種抗性的原因?qū)τ谥贫剐怨芾聿呗院蜑樾罗r(nóng)藥的開(kāi)發(fā)提供信息非常重要。目前，該研究比較了撒哈拉以南非洲地區(qū)5年間從抗性和易感嗜人按蚊種群中收集的31個(gè)數(shù)據(jù)集的基因表達(dá)模式，以確定模式并提供對(duì)殺蟲(chóng)劑抗性機(jī)制的見(jiàn)解。
LSTM希拉里蘭森教授是這篇論文的資深作者。她說(shuō)：“在過(guò)去的幾十年里，由于殺蟲(chóng)劑的使用，大多數(shù)瘧疾死亡人數(shù)已經(jīng)大大減少。殺蟲(chóng)劑抗藥性的增加對(duì)這些基本工具構(gòu)成了可信的威脅。闡述了蚊蟲(chóng)發(fā)展了許多防治農(nóng)藥的方法；這些知識(shí)是制定應(yīng)對(duì)耐藥性戰(zhàn)略的關(guān)鍵”
本文中使用的數(shù)據(jù)收集在一起，可以在LSTM托管的一個(gè)新的基于網(wǎng)絡(luò)的應(yīng)用程序中獲得。該應(yīng)用程序被稱為IR-TEx(殺蟲(chóng)劑抗藥性轉(zhuǎn)錄本瀏覽器)，可以免費(fèi)訪問(wèn)，其他研究人員和政策制定者也可以使用它來(lái)更好地向他們通報(bào)撒哈拉以南非洲不同地方的抗藥性機(jī)制。該應(yīng)用程序由英厄姆博士設(shè)計(jì)，以更易于訪問(wèn)的格式呈現(xiàn)數(shù)據(jù)，這對(duì)于不熟悉編程的人來(lái)說(shuō)更容易。她說(shuō)：“我們始終認(rèn)為，這項(xiàng)工作是完全開(kāi)放的，讓別人來(lái)解決自己的研究問(wèn)題?？砂次梅N、國(guó)家、農(nóng)藥類別綜合搜索，可下載。它對(duì)用戶友好，可以根據(jù)現(xiàn)場(chǎng)情況供那些人使用?！?
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