赫爾辛基大學的一個研究小組介紹了一項關(guān)于人類轉(zhuǎn)錄因子的新的大規(guī)模研究，該研究結(jié)合了兩種最先進的相互作用組學方法，可以快速識別蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用和這一重要基因家族的廣泛功能信息。
轉(zhuǎn)錄因子 (TFs) 是細胞發(fā)育、分化和維持體內(nèi)平衡最重要的蛋白質(zhì)組。它們在所有發(fā)育階段的細胞中驅(qū)動復雜的基因表達模式。TF 信號傳導的缺陷通常會導致發(fā)育障礙和疾病。
然而，雖然 TF DNA 結(jié)合已被廣泛研究，但我們?nèi)匀蝗狈?TF 活性和信號傳導如何通過與多種蛋白質(zhì)(例如輔因子、二聚化伙伴、染色質(zhì)調(diào)節(jié)蛋白、酶、抑制蛋白)相互作用來控制的系統(tǒng)級理解和一般轉(zhuǎn)錄因子。
赫爾辛基大學的一個研究小組決定啟動一項大型研究，以闡明 TF 蛋白-蛋白質(zhì)相互作用和 TF 調(diào)控。這項新研究發(fā)表在《自然通訊》上。
“我們對 100 多個 TF 進行了全面的相互作用組分析，揭示了 7,000 多個 TF 蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用，其中大部分在核中并在轉(zhuǎn)錄調(diào)控中發(fā)揮重要作用，”HiLIFE 生物技術(shù)研究所的研究主任 Markku Varjosalo 說。
研究結(jié)果為進一步研究 TF 監(jiān)管鋪平了道路
本研究中發(fā)現(xiàn)的大量 TF 相互作用使研究人員能夠進行系統(tǒng)級分析，揭示具有特定生物學功能的 TF 組，例如染色質(zhì)重塑和 RNA 剪接。
“有趣的是，幾乎一半的研究 TF 與 TF 的核因子家族相互作用。已知核因子在發(fā)育過程中控制過多的基因和器官發(fā)生，它們的異常活動與幾種人類癌癥類型有關(guān)。我們的數(shù)據(jù)表明轉(zhuǎn)錄控制NFI 可能受到核因子與其他 TF 相互作用的調(diào)節(jié)，”該研究的主要作者 Helka Göös 博士說。
該研究首次對人類轉(zhuǎn)錄因子的物理和功能相互作用進行了全面而互補的概述。新發(fā)現(xiàn)為進一步研究 TF 監(jiān)管鋪平了道路。
“在過去的 10 年里，我們的實驗室一直在積極參與識別和研究癌癥和免疫缺陷中個體轉(zhuǎn)錄因子突變的疾病機制。TFs 已被證明是困難的藥物靶標，但它們的幾個關(guān)鍵調(diào)節(jié)劑更有希望。我們生成的關(guān)于 TF 的大量信息圖譜可以作為藥物發(fā)現(xiàn)研究的豐富資源，以確定 TF 相關(guān)疾病的藥物治療，”Varjosalo 博士說。
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