赫爾辛基大學(xué)的一個(gè)研究小組介紹了一項(xiàng)關(guān)于人類轉(zhuǎn)錄因子的新的大規(guī)模研究，該研究結(jié)合了兩種最先進(jìn)的相互作用組學(xué)方法，可以快速識(shí)別蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用和這一重要基因家族的廣泛功能信息。
轉(zhuǎn)錄因子 (TFs) 是細(xì)胞發(fā)育、分化和維持體內(nèi)平衡最重要的蛋白質(zhì)組。它們?cè)谒邪l(fā)育階段的細(xì)胞中驅(qū)動(dòng)復(fù)雜的基因表達(dá)模式。TF 信號(hào)傳導(dǎo)的缺陷通常會(huì)導(dǎo)致發(fā)育障礙和疾病。
然而，雖然 TF DNA 結(jié)合已被廣泛研究，但我們?nèi)匀蝗狈?duì) TF 活性和信號(hào)傳導(dǎo)如何通過(guò)與多種蛋白質(zhì)(例如輔因子、二聚化伙伴、染色質(zhì)調(diào)節(jié)蛋白、酶、抑制蛋白)相互作用來(lái)控制的系統(tǒng)級(jí)理解和一般轉(zhuǎn)錄因子。
赫爾辛基大學(xué)的一個(gè)研究小組決定啟動(dòng)一項(xiàng)大型研究，以闡明 TF 蛋白-蛋白質(zhì)相互作用和 TF 調(diào)控。這項(xiàng)新研究發(fā)表在《自然通訊》上。
“我們對(duì) 100 多個(gè) TF 進(jìn)行了全面的相互作用組分析，揭示了 7,000 多個(gè) TF 蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用，其中大部分在核中并在轉(zhuǎn)錄調(diào)控中發(fā)揮重要作用，”HiLIFE 生物技術(shù)研究所的研究主任 Markku Varjosalo 說(shuō)。
研究結(jié)果為進(jìn)一步研究 TF 監(jiān)管鋪平了道路
本研究中發(fā)現(xiàn)的大量 TF 相互作用使研究人員能夠進(jìn)行系統(tǒng)級(jí)分析，揭示具有特定生物學(xué)功能的 TF 組，例如染色質(zhì)重塑和 RNA 剪接。
“有趣的是，幾乎一半的研究 TF 與 TF 的核因子家族相互作用。已知核因子在發(fā)育過(guò)程中控制過(guò)多的基因和器官發(fā)生，它們的異?；顒?dòng)與幾種人類癌癥類型有關(guān)。我們的數(shù)據(jù)表明轉(zhuǎn)錄控制NFI 可能受到核因子與其他 TF 相互作用的調(diào)節(jié)，”該研究的主要作者 Helka Göös 博士說(shuō)。
該研究首次對(duì)人類轉(zhuǎn)錄因子的物理和功能相互作用進(jìn)行了全面而互補(bǔ)的概述。新發(fā)現(xiàn)為進(jìn)一步研究 TF 監(jiān)管鋪平了道路。
“在過(guò)去的 10 年里，我們的實(shí)驗(yàn)室一直在積極參與識(shí)別和研究癌癥和免疫缺陷中個(gè)體轉(zhuǎn)錄因子突變的疾病機(jī)制。TFs 已被證明是困難的藥物靶標(biāo)，但它們的幾個(gè)關(guān)鍵調(diào)節(jié)劑更有希望。我們生成的關(guān)于 TF 的大量信息圖譜可以作為藥物發(fā)現(xiàn)研究的豐富資源，以確定 TF 相關(guān)疾病的藥物治療，”Varjosalo 博士說(shuō)。
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