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研究人員挖掘數(shù)據(jù)并關(guān)聯(lián)驅(qū)動(dòng)神經(jīng)母細(xì)胞瘤的過(guò)程

導(dǎo)讀 (田納西州孟菲斯-2020年10月14日)研究人員利用神經(jīng)母細(xì)胞瘤綜合基因組分析的見(jiàn)解,了解了導(dǎo)致兒童最常見(jiàn)的實(shí)體瘤之一的過(guò)程。這些結(jié)果揭示

(田納西州孟菲斯-2020年10月14日)研究人員利用神經(jīng)母細(xì)胞瘤綜合基因組分析的見(jiàn)解,了解了導(dǎo)致兒童最常見(jiàn)的實(shí)體瘤之一的過(guò)程。這些結(jié)果揭示了開(kāi)發(fā)精確藥物以改善患者預(yù)后的可能方法。圣裘德兒童研究醫(yī)院的科學(xué)家領(lǐng)導(dǎo)了這項(xiàng)研究,該研究發(fā)表在今天的《自然通訊》雜志上。

對(duì)702例神經(jīng)母細(xì)胞瘤標(biāo)本進(jìn)行了全基因組、外顯子和轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析。包括來(lái)自復(fù)發(fā)患者的23個(gè)樣本。這項(xiàng)工作確定了研究人員希望通過(guò)治療使用的常見(jiàn)突狀之間的關(guān)聯(lián)。

“這是對(duì)大量腫瘤的綜合分析,有助于了解神經(jīng)母細(xì)胞瘤中以前未被認(rèn)識(shí)到的相關(guān)性,找到罕見(jiàn)的驅(qū)動(dòng)基因突變,”圣裘德氏病科對(duì)應(yīng)作者張景輝博士說(shuō)。計(jì)算生物學(xué)。

通信作者是圣裘德發(fā)育神經(jīng)生物學(xué)部主任、霍華德休斯醫(yī)學(xué)研究所研究員、邁克爾戴爾博士和費(fèi)城兒童醫(yī)院醫(yī)學(xué)博士邁克爾霍加蒂。

常見(jiàn)突變和氧化應(yīng)激的連接點(diǎn)

研究人員使用一種類似指紋的常見(jiàn)突變模式來(lái)識(shí)別促進(jìn)腫瘤生長(zhǎng)和擴(kuò)散的內(nèi)部過(guò)程。研究人員知道,神經(jīng)母細(xì)胞瘤中稱為活性氧和氧化應(yīng)激的脫氧核糖核酸損傷分子會(huì)增加?;钚匝踉诩?xì)胞的線粒體中產(chǎn)生。分析表明,65%的神經(jīng)母細(xì)胞瘤染色體突變與脫氧核糖核酸損傷分子相關(guān)。這些腫瘤有一條額外的17號(hào)染色體。這部分包括在線粒體中表達(dá)的基因。結(jié)果表明,線粒體基因缺陷可能導(dǎo)致活性氧產(chǎn)生增加,從而加重腫瘤的生長(zhǎng)和耐藥性。

圣裘德云對(duì)39種癌癥類型的1000多個(gè)兒科腫瘤基因組的搜索發(fā)現(xiàn),這種關(guān)聯(lián)并不是唯一的。研究人員報(bào)告稱,來(lái)自另一種癌癥(橫紋肌肉瘤)的樣本中,超過(guò)20%的樣本線粒體基因表達(dá)增加,氧化應(yīng)激增加。這一發(fā)現(xiàn)加強(qiáng)了新發(fā)現(xiàn)的線粒體基因缺陷和突變過(guò)程之間的聯(lián)系。

戴爾說(shuō):“通過(guò)這一分析,我們對(duì)驅(qū)動(dòng)神經(jīng)母細(xì)胞瘤的變化有了更深入的了解,包括腫瘤的形成、進(jìn)展和對(duì)治療的反應(yīng)?!薄斑@是轉(zhuǎn)化研究的基礎(chǔ)?!?

神經(jīng)母細(xì)胞瘤預(yù)測(cè)因子

神經(jīng)母細(xì)胞瘤發(fā)生在胎兒神經(jīng)細(xì)胞中,稱為神經(jīng)母細(xì)胞瘤,不能正常成熟。雖然7-10%的兒童癌癥是神經(jīng)母細(xì)胞瘤,但它占嬰兒所有癌癥的一半。癌癥通常始于腎上腺,但也可能始于胸部、脊柱或脊髓區(qū)域、腹部和其他區(qū)域。

而且治療方法和結(jié)果因患者年齡而異。最年輕患者(小于18個(gè)月)的存活率約為95%。對(duì)于老年和高?;颊撸媛手挥?0%左右。

這項(xiàng)研究加強(qiáng)了患者年齡和導(dǎo)致疾病的突變之間的關(guān)系。例如,基因MYCN和TERT通常在3.8歲或更小的患者中發(fā)生變化,而ATRX突變?cè)谥形荒挲g為5.6歲的兒童中更為常見(jiàn)。

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