對(duì) SARS-CoV-2(導(dǎo)致 的病毒)以及人類和動(dòng)物中的相關(guān)病毒的變種進(jìn)行遺傳和地理分析，可能會(huì)提供世界范圍內(nèi)種間傳播的證據(jù)。生態(tài)健康聯(lián)盟和孟加拉國流行病學(xué)、疾病控制與研究所的 Ariful Islam 博士及其同事于 2021 年 12 月 15 日在開放獲取期刊 PLOS ONE 上介紹了這些發(fā)現(xiàn)。
先前的研究表明，SARS-CoV-2 可能起源于馬蹄蝠中密切相關(guān)的病毒之間發(fā)生的基因變化。報(bào)告還表明，該病毒可以從人類傳播到馴養(yǎng)和野生動(dòng)物(稱為溢出)。然而，關(guān)于 SARS-CoV-2 與世界各地動(dòng)物相關(guān)病毒之間的流行病學(xué)、進(jìn)化動(dòng)力學(xué)和遺傳關(guān)系，還有很多有待了解。
為了提供新的見解，Islam 博士及其同事對(duì)蝙蝠和穿山甲中發(fā)現(xiàn)的 SARS-CoV-2 相關(guān)病毒的基因組序列以及在各種世界各地的動(dòng)物，包括狗、貓和獅子。
遺傳分析表明，在動(dòng)物中發(fā)現(xiàn)的 SARS-CoV-2 毒株與在同一地理區(qū)域(包括德國、法國、西班牙和丹麥)中發(fā)現(xiàn)的人類毒株密切相關(guān)，這證明了人與動(dòng)物傳播已在世界范圍內(nèi)發(fā)生的理論。將來，如果該病毒在動(dòng)物宿主中建立，那么該動(dòng)物物種可能會(huì)成為 SARS-CoV-2 的宿主。
研究人員還量化了在不同地區(qū)的動(dòng)物物種中發(fā)現(xiàn)的與關(guān)鍵 SARS-CoV-2 亞型和變體相關(guān)的基因突變的程度。在許多國家的狗、大猩猩、獅子和貓等物種中發(fā)現(xiàn)了多個(gè)令人關(guān)注的新興變異，例如 Alpha、Delta 和 Mu 變異，這些變異與人類 SARS-CoV-2 序列顯示出顯著的遺傳相似性。例如，貓和美洲貂經(jīng)常感染一種被稱為 GR 進(jìn)化枝的病毒亞型(分別占樣本的 31.6% 和 49.7%)，這在人類中也很常見，支持了種間傳播的可能性。然而，大多數(shù)狗都受到不同亞型 O 進(jìn)化枝(66.7%)的影響，作者認(rèn)為這表明進(jìn)化枝 O 對(duì)狗具有特殊的親和力。
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