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研究人員使用 loop-seq 技術(shù)破譯 DNA 的機(jī)械代碼

導(dǎo)讀 一項(xiàng)新的研究破譯了 DNA 的機(jī)械密碼,揭示了自然界在 DNA 序列中編碼生物信息的以前未知的方式。在英國(guó)杜倫大學(xué)的領(lǐng)導(dǎo)下,一個(gè)國(guó)際研究

一項(xiàng)新的研究破譯了 DNA 的機(jī)械密碼,揭示了自然界在 DNA 序列中編碼生物信息的以前未知的方式。

在英國(guó)杜倫大學(xué)的領(lǐng)導(dǎo)下,一個(gè)國(guó)際研究小組使用了他們開(kāi)發(fā)的一種名為 loop-seq 的下一代基于 DNA 測(cè)序的技術(shù),以證明沿著 DNA 區(qū)域的局部堿基序列決定了 DNA 的局部可彎曲性脫氧核糖核酸。

通過(guò)大量測(cè)量,再加上計(jì)算分析和機(jī)器學(xué)習(xí),他們確定了機(jī)械代碼,即局部序列與 DNA 局部可變形性之間的映射。

此外,研究人員發(fā)現(xiàn) DNA 的機(jī)械代碼可以通過(guò)“甲基化”進(jìn)行修改,這是一種已知的化學(xué)修飾,DNA 堿基在生物體發(fā)育的各個(gè)階段經(jīng)常受到這種修飾。異常甲基化與多種癌癥有關(guān)。

甲基化改變機(jī)械代碼的發(fā)現(xiàn)表明,生物發(fā)育程序或癌癥等疾病可能通過(guò)改變機(jī)械代碼編碼的信息來(lái)實(shí)現(xiàn)其對(duì)細(xì)胞的部分影響。

這項(xiàng)研究是與來(lái)自美國(guó)約翰霍普金斯大學(xué)、西班牙巴塞羅那科技學(xué)院和西班牙巴塞羅那大學(xué)的同事一起進(jìn)行的。它已發(fā)表在《自然結(jié)構(gòu)與分子生物學(xué)》雜志上。

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