肺炎是由細(xì)菌、病毒或真菌引起的肺泡感染。它是全世界發(fā)病和死亡的主要原因之一，造成臨床和經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)以及全球公共衛(wèi)生問(wèn)題。人類呼吸道的微生物生態(tài)系統(tǒng)(或微生物組)占據(jù)不同的生態(tài)位?？茖W(xué)家對(duì)呼吸道微生物組很感興趣，因?yàn)樗ㄟ^(guò)刺激免疫系統(tǒng)和防止病原體感染來(lái)促進(jìn)人類健康。巴斯德研究所和法國(guó)國(guó)家科學(xué)研究中心的科學(xué)家證明，微生物組組成、病原體負(fù)荷和臨床干預(yù)措施會(huì)影響嗜肺軍團(tuán)菌引起的細(xì)菌性肺炎的嚴(yán)重程度。研究結(jié)果發(fā)表在《細(xì)胞報(bào)告醫(yī)學(xué)》雜志上2023 年 8 月 25 日。
在這項(xiàng)研究中，巴斯德研究所 Carmen Buchrieser 領(lǐng)導(dǎo)的細(xì)胞內(nèi)細(xì)菌生物學(xué)單位的科學(xué)家與里昂軍團(tuán)菌國(guó)家參考中心主任 Sophie Jarraud 合作，分析了呼吸道微生物群的多樣性和組成。細(xì)胞內(nèi)細(xì)菌病原體嗜肺軍團(tuán)菌引起的肺炎患者在整個(gè)住院期間都應(yīng)避免感染細(xì)菌、古細(xì)菌、真菌和原生動(dòng)物。嗜肺軍團(tuán)菌導(dǎo)致一種被稱為退伍軍人病的嚴(yán)重肺炎，這種肺炎可以通過(guò)吸入淋浴、熱水浴缸或空調(diào)系統(tǒng)等人工水源中受污染的氣溶膠而感染。軍團(tuán)病的死亡率從 5% 到 40% 不等，具體取決于臨床情況和地區(qū)。危險(xiǎn)因素包括年老、已有肺部疾病、吸煙和免疫抑制，大約三分之二的報(bào)告病例發(fā)生在男性。歐盟軍團(tuán)病確診病例從2005年的4,693例增加到2021年的10,004例，增長(zhǎng)了113%。這種急劇上升的原因之一可能是氣候變化，
科學(xué)家團(tuán)隊(duì)將高通量細(xì)菌、古菌和真菌標(biāo)記基因測(cè)序與定量方法相結(jié)合，以描述患者在感染過(guò)程中以及醫(yī)院相關(guān)干預(yù)措施(例如機(jī)械通氣和呼吸機(jī)等)中呼吸道微生物群的發(fā)展情況?？股氐墓芾?。由 38 名嗜肺軍團(tuán)菌引起的肺炎住院患者組成的獨(dú)特隊(duì)列被分析了。該研究的主要作者、巴斯德研究所細(xì)胞內(nèi)細(xì)菌生物學(xué)部門(mén)負(fù)責(zé)人 Carmen Buchrieser 解釋道：“我們發(fā)現(xiàn)了復(fù)雜的微生物組動(dòng)態(tài)，其中共生微生物和病原微生物共存，它們豐度之間的平衡會(huì)驅(qū)動(dòng)微生物組恢復(fù)或生態(tài)失調(diào)。”科學(xué)家們觀察到，在住院初期，微生物組多樣性下降，病原體嗜肺軍團(tuán)菌被抗生素治療殺死。但這一空缺很快就被其他機(jī)會(huì)性物種占據(jù)，這些物種通常對(duì)抗菌藥物具有抗藥性——這是繼發(fā)感染預(yù)防策略中應(yīng)考慮的因素。細(xì)菌和真菌負(fù)荷最高的呼吸道微生物組也表現(xiàn)出較低的多樣性和病原體富集度，表明高生物量可能是繼發(fā)和/或合并感染的生物標(biāo)志物。最后，科學(xué)家們表明軍團(tuán)菌生物量與疾病嚴(yán)重程度和合并癥相關(guān)，這表明病原體定量應(yīng)納入患者監(jiān)測(cè)中。機(jī)械通氣或施用某些類型的抗生素等臨床干預(yù)措施會(huì)影響微生物組的組成，從而影響疾病的結(jié)果。
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