研究人員建立發(fā)酵原核生物的交互式綜合數(shù)據(jù)庫(kù) 工程家用機(jī)器人要有一點(diǎn)常識(shí) 難以捉摸的 3D 打印納米粒子可能會(huì)帶來(lái)新的變形材料 挖掘現(xiàn)場(chǎng)的發(fā)現(xiàn)表明古代藝術(shù)家可能受到保存下來(lái)的恐龍腳印的啟發(fā) 大型語(yǔ)言模型使用一種非常簡(jiǎn)單的機(jī)制來(lái)檢索一些存儲(chǔ)的知識(shí) 研究人員發(fā)現(xiàn)真菌的進(jìn)化臨界點(diǎn) 為組合優(yōu)化問(wèn)題的高質(zhì)量解決方案提出的新型量子算法 研究記錄了大西洋洋流的減慢 催化突破產(chǎn)生自潔墻面涂料 在陽(yáng)光照射下可分解空氣污染物 白點(diǎn)癲風(fēng)能徹底治好嗎(白癜風(fēng)能治愈嗎) 睪丸囊腫是什么原因引起(睪丸囊腫怎么回事) 月經(jīng)期怎豐胸(月經(jīng)期間豐胸的辦法) 怎么能夠快速懷孕呢(怎樣才能快速懷孕呢) 八歲兒童喝什么牛奶(8歲兒童喝什么牛奶好) 喘息性支氣管炎用什么藥效果好(喘息性支氣管炎怎么辦) 女性絕經(jīng)后的保養(yǎng)措施(女性絕經(jīng)后的保養(yǎng)) 胎盤吃了對(duì)孩子命運(yùn)影響嗎(吃胎盤的功效與作用) 玫瑰花的作用和功效(桂花的作用) 激光祛斑多少錢一次?(激光祛斑多少錢) 避孕套應(yīng)該怎么戴才正確(避孕套應(yīng)該怎么戴) 眼瞼是哪個(gè)部位示意圖(眼瞼是哪) 去黑頭的藥品有哪些(去黑頭的藥物有哪些) 髓母細(xì)胞瘤是先天性的嗎嚴(yán)重嗎(髓母細(xì)胞瘤是先天性的嗎) 補(bǔ)肝的中成藥有哪些藥(補(bǔ)肝的中成藥有哪些) 男人睪丸疝氣怎么治療(疝氣怎么治療) 補(bǔ)精最好的食物(補(bǔ)精子最有效的食物) 孕早期癥狀像感冒(孕早期癥狀) 上火嘴起泡怎么快速消除掉(上火嘴起泡怎么快速消除) 經(jīng)常吃紫薯有什么好處(吃紫薯有什么好處) 增強(qiáng)免疫力食物與食療方(增強(qiáng)免疫力食物) 棗花蜜的作用和功效(棗花蜜的功效是什么) 孕前檢查查什么科(孕前檢查都是查什么) 血糖低的癥狀或表現(xiàn)和處理(血糖低的癥狀) 寶寶溢奶與吐奶區(qū)別(嬰兒溢奶和吐奶的區(qū)別) 手上長(zhǎng)瘊子怎樣治療(手上長(zhǎng)瘊子治療的方法) 桑葚干可以泡酒嗎?要用什么白酒呢(桑葚干可以泡酒嗎) 桑葉的功效與作用是什么?(桑葉的功效與作用是什么) 傷口感染化膿用什么藥好得快(傷口化膿怎么處理) 熱痙攣的急救措施(熱痙攣怎么治療) 剛出生的嬰兒?jiǎn)苣淘趺崔k(嬰兒?jiǎn)苣淘趺崔k) 來(lái)月經(jīng)期可以吃西瓜嗎?(來(lái)月經(jīng)期間能吃西瓜嗎) 腳一熱就發(fā)癢是怎么回事(腳發(fā)癢怎么辦) 腳底長(zhǎng)水泡是什么原因引起的很癢(腳底長(zhǎng)水泡是什么原因) 藿香正氣水功效與作用說(shuō)明書(藿香正氣水功效與作用) 茴香的作用與效果(茴香的功效是什么) 踝振攣檢查方法(踝震攣的癥狀) 喝酒皮膚過(guò)敏圖片大全(喝酒皮膚過(guò)敏如何處理) 每天喝綠茶能瘦嗎(每天喝綠茶能減肥嗎)
您的位置:首頁(yè) >行業(yè)觀察 >

研究人員建立發(fā)酵原核生物的交互式綜合數(shù)據(jù)庫(kù)

導(dǎo)讀 大多數(shù)生物利用氧氣將食物轉(zhuǎn)化為能量。然而,在氧氣很少或沒有氧氣的環(huán)境中,生命找到了其他產(chǎn)生能量的方法,即使用一種稱為發(fā)酵的過(guò)程。發(fā)...

大多數(shù)生物利用氧氣將食物轉(zhuǎn)化為能量。然而,在氧氣很少或沒有氧氣的環(huán)境中,生命找到了其他產(chǎn)生能量的方法,即使用一種稱為發(fā)酵的過(guò)程。

發(fā)酵代謝發(fā)生在反芻動(dòng)物腸道、沉積物和厭氧生物反應(yīng)器等環(huán)境中。除了產(chǎn)生生物體可以用來(lái)繁衍的能量外,該過(guò)程還可以產(chǎn)生其他最終產(chǎn)品,包括生物燃料和其他生物產(chǎn)品。

為了更好地了解依賴這種新陳代謝形式的細(xì)菌和古細(xì)菌的范圍,研究人員最近編制了一份清單,其中包含來(lái)自多個(gè)來(lái)源的 8,300 多種生物體,其中包括美國(guó)能源部 (DOE) 聯(lián)合基因組研究所 (JGI)科學(xué)用戶設(shè)施辦公室位于勞倫斯伯克利國(guó)家實(shí)驗(yàn)室(伯克利實(shí)驗(yàn)室)和能源部系統(tǒng)生物學(xué)知識(shí)庫(kù)(KBase)。

他們還構(gòu)建了一個(gè)交互式瀏覽器,允許其他研究人員研究基因組并預(yù)測(cè)可能在缺氧或無(wú)氧環(huán)境中繁衍生息的微生物的代謝能力。該研究發(fā)表在《科學(xué)進(jìn)展》上。

加州大學(xué)戴維斯分校和加州大學(xué)圣巴巴拉分校的研究人員從文獻(xiàn)中生成了具有發(fā)酵代謝功能的原核生物列表。然后,他們使用 JGI 的 GOLD 和 IMG 數(shù)據(jù)門戶來(lái)獲取有關(guān)列表中生物體的基因組和基因的信息。他們還在 IMG/M 中搜索了屬于每個(gè)基因組的所有蛋白質(zhì)編碼基因。

最終數(shù)據(jù)集(研究界可以通過(guò)在線交互式瀏覽器獲取)包含 8,350 個(gè)生物體的表型記錄以及 4,355 個(gè)基因組和 1,360 萬(wàn)個(gè)基因。結(jié)果表明,三分之一的原核生物存在發(fā)酵代謝,可形成大約 300 種代謝物組合。

標(biāo)簽:

免責(zé)聲明:本文由用戶上傳,如有侵權(quán)請(qǐng)聯(lián)系刪除!

最新文章