來自新加坡科技研究局基因組研究所(GIS)和生物信息學研究所(BII)的科學家團隊開發(fā)了一種名為“BANKSY”的新型人工智能軟件工具,可以自動識別組織中存在的細胞類型,例如肌肉細胞、神經(jīng)細胞和脂肪細胞。
傳統(tǒng)的人工智能工具可以將包含相似分子的細胞聚集成簇,班克斯還考慮了組織中細胞周圍環(huán)境的相似程度,這比傳統(tǒng)的人工智能工具更進一步。
通過 BANKSY,研究人員將能夠更快、更準確地提高對多種疾病組織過程的理解,這可以支持開發(fā)更有效的癌癥、神經(jīng)系統(tǒng)疾病和其他疾病的診斷和治療方法。這項研究發(fā)表在《Nature Genetics》上的文章“BANKSY Unified Cell Typing and Organization Domain Segmentation for Scalable Spatialomics Data Analysis”中。
BANKSY 擅長識別組織樣本生成的空間分子譜中細微不同的細胞群。此外,班克斯解決了在組織切片中劃分功能不同的解剖區(qū)域的獨特但相關的問題。例如,它可以區(qū)分人類前腦的分層結構。
空間分子分析(空間組學)技術是功能強大的顯微鏡,使科學家能夠通過揭示細胞中單個生物分子的確切位置以及組織中細胞的排列來詳細研究組織。
這有助于他們了解細胞如何在組織中聚集以執(zhí)行其正常的生理功能,以及它們在癌癥、自閉癥或 COVID-19 等傳染病等疾病中的行為(或不當行為)。這種理解對于更準確的診斷和對患者進行量身定制的治療以及新藥的發(fā)現(xiàn)至關重要。
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