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統(tǒng)計(jì)建模為 DNA 折疊的統(tǒng)一理論指明了方向

導(dǎo)讀 華盛頓,2021 年 9 月 21 日——人類(lèi) DNA 分子長(zhǎng)度超過(guò) 2 米,使用復(fù)雜的折疊模式適應(yīng)細(xì)胞,同時(shí)局部展開(kāi)以表達(dá)基因。然而,這些

華盛頓,2021 年 9 月 21 日——人類(lèi) DNA 分子長(zhǎng)度超過(guò) 2 米,使用復(fù)雜的折疊模式適應(yīng)細(xì)胞,同時(shí)局部展開(kāi)以表達(dá)基因。然而,這些現(xiàn)象在實(shí)驗(yàn)中很難測(cè)量,解釋它們的理論框架仍然相互矛盾。

、和波蘭的研究人員試圖為 DNA 在表達(dá)基因時(shí)如何改變形狀提供統(tǒng)一理論。科學(xué)家們?cè)?AIP Publishing 出版的 Biophysics Reviews 上展示了他們的工作,他們使用一種稱為統(tǒng)計(jì)力學(xué)的方法來(lái)探索所謂的基因調(diào)控表達(dá)波現(xiàn)象。

該小組希望調(diào)和與該主題最相關(guān)的兩個(gè)科學(xué)領(lǐng)域之間長(zhǎng)期存在的鴻溝。

共同作者亞歷山德羅·朱利安尼 (Alessandro Giuliani) 說(shuō):“許多處于物理學(xué)和生物學(xué)交叉路口的學(xué)者現(xiàn)在正在研究可能是生物學(xué)中最關(guān)鍵的難題。”“從受精卵的相同遺傳背景開(kāi)始,怎么可能出現(xiàn)大約 400 種高度分化的細(xì)胞類(lèi)型,每種類(lèi)型都具有特定的生理作用?”

基于生物學(xué)的理論通常以稱為轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)節(jié)蛋白為中心,這些蛋白通過(guò)生化方式指揮要一起表達(dá)的基因交響曲。相比之下,許多物理學(xué)家專注于表達(dá)波,即由 DNA 分子本身的松弛和凝聚驅(qū)動(dòng)的基因組表達(dá)水平的有節(jié)奏變化。

朱利安尼說(shuō):“這有點(diǎn)像足球和其他體育賽事中常見(jiàn)的所謂的hola,觀眾同時(shí)站起來(lái),在整個(gè)體育場(chǎng)內(nèi)產(chǎn)生‘波浪’。”

為了解決這個(gè)問(wèn)題的核心,該小組專注于在乳腺癌中發(fā)現(xiàn)的一種特定類(lèi)型的細(xì)胞,該細(xì)胞具有持續(xù)以相同方式刺激的記錄。

他們使用統(tǒng)計(jì)力學(xué)通過(guò)評(píng)估大量微觀參與者在整體屬性方面的集體行為來(lái)理解 DNA 分子如何折疊,這與經(jīng)典的自上而下的觀點(diǎn)不同,如牛頓定律。

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