返回基因組研究結(jié)果揭示了未被認識的疾病風險

攜帶癌癥和心臟病遺傳風險的生物樣本庫志愿者中有四分之三從未接受過檢測

與測序相比，基于陣列的測試在 45% 的樣本中產(chǎn)生錯誤結(jié)果，并漏掉了 72% 攜帶可治療疾病的危險風險變異的樣本

超過 120,000 名患者加入了 Mass General Brigham 生物銀行，提供有關其健康史的重要信息、回答調(diào)查問題以及捐贈或計劃捐贈血液樣本的途徑。他們的慷慨參與使研究人員能夠研究個人的健康如何受到他們的基因、生活方式和環(huán)境的影響。許多患者現(xiàn)在得到了一些回報：醫(yī)學上可行的基因組研究結(jié)果。其中一些生物銀行參與者正在了解可用于預防癌癥和心臟病的風險增加的遺傳標記。

在《美國人類遺傳學雜志》上發(fā)表的一項新研究中，來自布萊根婦女醫(yī)院、馬薩諸塞州總醫(yī)院和哈佛醫(yī)學院的研究人員描述了他們從向研究參與者披露可操作的遺傳結(jié)果并將其轉(zhuǎn)變?yōu)榕R床護理的經(jīng)驗中吸取的教訓。該團隊向 256 名參與者返回了結(jié)果，其中 76.3% 的人不知道他們攜帶了一種使他們面臨更高風險的變體，盡管其中大約一半符合基因檢測的臨床標準。

“許多人的病歷中已經(jīng)記錄了個人或家族健康史，表明他們應該接受基因檢測，但從未進行過，還有其他人沒有家族病史或癥狀，臨床上提示醫(yī)生，但仍然攜帶危險遺傳風險變異，”共同主要作者、布里格姆Genomes2People(G2P) 研究項目的高級遺傳顧問Carrie Blout Zawatsky, MS, CGC 說。“我們的研究結(jié)果表明，基因組篩查可以通過識別不知道自己處于危險之中的個體來為患者帶來挽救生命的好處。”

超過 87,000 名 Biobank 參與者提供了血液樣本，研究團隊對其中 36,417 個樣本進行了基因組分析。該團隊專注于美國醫(yī)學遺傳學和基因組學學院指定的 59 個基因，這些基因在醫(yī)學上是可行的，并且只返回預計會增加風險的變異。樣本最初進行基因分型，這是一種僅測試基因組中特定位點的技術，并且還對一個子集進行了測序(一種更全面的方法)以進行比較。在通知參與者之前，該團隊驗證了基因分型結(jié)果，發(fā)現(xiàn)這些變體中有 45% 是不正確的，所以他們沒有被報告。此外，基因分型未能識別出綜合測序檢測到的 72% 的危險變異。這些發(fā)現(xiàn)證明了基因分型方法的局限性。在完全披露結(jié)果之前，所有變異都通過來自參與者的額外樣本進行了臨床確認。

“許多生物庫依賴基因分型技術而不是基因組測序。我們的研究表明，基因分型雖然是研究中的一種有用工具，但可能會錯過更全面的測序檢測到的重要結(jié)果，”共同資深作者、馬修·布萊根分子醫(yī)學實驗室首席實驗室主任、FACMG Matthew Lebo 博士說。“在這項研究中，通過測序確認基因型發(fā)現(xiàn)至關重要，因為它允許我們過濾掉假陽性。”

該團隊提醒 256 名參與者他們攜帶了可操作的基因組結(jié)果，但其中 38% 的人拒絕收到他們的結(jié)果，這通常是因為他們正在處理其他醫(yī)療保健問題。重要的是，該團隊跟蹤了返回基因組結(jié)果的成本，發(fā)現(xiàn)整個 Biobank 人群中每位參與者的總成本為 14 美元。

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