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超級計算機加入了對抗抗生素耐藥性的斗爭

導讀 參與的研究人員在波鴻魯爾大學(RUB)、德國杜伊斯堡-埃森大學(UDE)、英國樸茨茅斯大學以及澳大利亞昆士蘭大學和以色列魏茨曼研究所工作。新

參與的研究人員在波鴻魯爾大學(RUB)、德國杜伊斯堡-埃森大學(UDE)、英國樸茨茅斯大學以及澳大利亞昆士蘭大學和以色列魏茨曼研究所工作。

新抗生素研發(fā)困難重重

開發(fā)一種新的抗生素特別困難,而且自 1960 年代以來,幾乎沒有開發(fā)出新的抗生素類別。在目前的研究中,研究人員采用了另一種方法。他們沒有開發(fā)一種全新的類型,而是從已經(jīng)存在的抗生素開始,然后對其進行修改。為此,他們使用了一種策略,通過計算模擬候選人的幾個方面。除其他外,抗生素的溶解度、穿透細菌膜的效率以及阻斷病原體蛋白質產(chǎn)生的效率對其有效性都很重要。“在實際合成之前對化合物是否具有活性進行計算評估避免了化學浪費。”RUB 的 RESOLV 教授 Frank Schulz 解釋道。

頭對頭

過去表明,對新抗生素產(chǎn)生抗藥性的時間通常不會太久。因此,預計細菌將針對研究人員的對策制定對策,并對新的抗生素變體產(chǎn)生抗藥性。“我們希望通過這項研究表明,可以通過計算策略以系統(tǒng)的方式解決細菌的耐藥機制,從而幫助更快、更經(jīng)濟地開發(fā)新的抗生素衍生物”,該研究所負責人 Elsa Sanchez-Garcia 教授解釋說。 UDE 的計算生物化學組和 RESOLV 的首席研究員。“通過這種方式,科學可以不斷地反擊新抗生素的計算機輔助開發(fā)。”

有前途的候選人

對超級計算機計算的結果進行了實驗測試。在研究中,研究團隊不僅實施了基于計算機的模擬方法,還提出了一種新的有前景的候選藥物。與世界衛(wèi)生組織基本藥物清單上的兩種已知抗生素相比,該候選藥物仍必須進行臨床測試,其對測試細菌菌株的活性高達 56 倍。新的抗生素變體不僅對測試的目標生物更有效,而且對世界衛(wèi)生組織優(yōu)先列表中排名最高的三種細菌也顯示出活性,而現(xiàn)有測試的抗生素對其無效。除了這一成功之外,還創(chuàng)建了一個具有抗菌活性的化合物庫,

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