Aging-US發(fā)表了“與環(huán)狀 RNA 相互作用的 RNA 結(jié)合蛋白和肝細(xì)胞癌樞紐候選網(wǎng)絡(luò)的鑒定”，其中報(bào)告了來(lái)自臨床蛋白質(zhì)組學(xué)腫瘤分析聯(lián)盟、癌癥基因組圖譜和國(guó)際癌癥基因組的 17 種 DERBP，在 HCC 中通常失調(diào)聯(lián)盟項(xiàng)目被用來(lái)構(gòu)建 RBP-circRNA 網(wǎng)絡(luò)。
此外，基因集富集分析表明，失調(diào)的 TARDBP 可能參與了一些與 HCC 發(fā)病機(jī)制相關(guān)的通路。
因此，基于 TARDBP 生成了一個(gè)集線器 RBP-circRNA 網(wǎng)絡(luò)。
RNA 免疫沉淀和 RNA 下拉證實(shí) hsa_circ_0004913 與 TARDBP 結(jié)合。
這些研究結(jié)果發(fā)表在Aging-US 上，表明某種 RBP-circRNA 調(diào)控網(wǎng)絡(luò)可能參與 HCC 的發(fā)病機(jī)制，這為 HCC 的研究機(jī)制和生物標(biāo)志物鑒定提供了新的見(jiàn)解。
南方醫(yī)科大學(xué)陳玉涵博士說(shuō)：“肝細(xì)胞癌(HCC)是最常見(jiàn)的原發(fā)性肝癌類型。”
先前的研究表明，circRNAs可以作為RNA結(jié)合蛋白的海綿，同時(shí)RBPs也能夠參與反向剪接。因此，與 RBPs 的相互作用也可以被視為探索 circRNAs 功能的關(guān)鍵因素。
然而，關(guān)于 RBP-circRNA 相互作用對(duì) HCC 的影響的研究很少，需要更多的探索。
在這項(xiàng)研究中，作者從基因表達(dá)綜合數(shù)據(jù)庫(kù)中篩選出 HCC 病例中差異表達(dá)的 circRNA，并預(yù)測(cè)了與 DEcircRNA 結(jié)合的 RBP。
在評(píng)估來(lái)自臨床蛋白質(zhì)組學(xué)腫瘤分析聯(lián)盟、國(guó)際癌癥基因組聯(lián)盟和癌癥基因組圖譜項(xiàng)目的 HCC 中 RBPs 的表達(dá)水平后，他們利用 17 個(gè)常見(jiàn)的 DERBPs 構(gòu)建了 HCC 中的 RBP-circRNA 調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。
這些發(fā)現(xiàn)表明某些RBP-circRNA網(wǎng)絡(luò)可能與HCC密切相關(guān)，為HCC的研究機(jī)制提供了思路。
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