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器官和組織再生過程中染色質的動態(tài)變化

來自巴塞羅納大學遺傳、微生物和統(tǒng)計系以及生物醫(yī)學研究所的研究人員與基因組調控中心(CRG)合作,描述了基因及其表達所需的調控元件。以及組織和器官再生的過程。該研究發(fā)表在《基因組研究雜志》封面,通過新一代測序將經典遺傳分析與新的染色質研究技術相結合,為再生醫(yī)學提供了新的視角。

這項研究的參與者是埃琳娜維斯卡亞-莫利納(UB)和塞西莉亞克萊因(UB-CRG),這是本文的第一批署名者,由蒙特塞拉特科羅米納斯(UB)領導。其他合作者是研究人員羅德里克吉吉戈(CRG,龐貝法布拉大學)、弗洛倫西塞拉(UB)和拉克什米什拉(CCMB,海得拉巴)。

再生基因

本文分析了果蠅翅膀不同再生階段成像盤的轉錄組。通過分析大規(guī)模的核糖核酸測序,他們發(fā)現(xiàn)了在這個過程中差異表達的基因。此外,他們發(fā)現(xiàn)這些基因中有30%以上位于基因簇中。通過比較和分析其他物種(小鼠和斑馬魚),作者發(fā)現(xiàn)了一組參與再生的基因,這些基因在所有這些物種中都是保守的。Elena Vizcaya-Molina指出:“知道哪些基因可以再生——這些基因有一些共同點,可以幫助我們了解在再生技能較為有限的生物體(如人類)中,激活這一過程需要什么條件。

“這項研究表明,組學和生物信息學對于理解基本生物過程變得越來越重要,”CRG博士后研究員、UB講師Cecilia Klein指出。新的測序技術以及生物信息學分析和實驗研究的結合使研究人員能夠在理解基因調控方面取得進展。在這種情況下,再生。

再生中的調節(jié)因素。

在這項研究中,研究人員還首次發(fā)現(xiàn)了三種與再生相關的調節(jié)元件:在再生過程中增加活性的調節(jié)元件、從其他發(fā)育階段或其他組織中重復使用的調節(jié)元件,以及最后一組,再生過程中的獨特元件?!斑@些調控元件是可以導致和塑造基因表達的DNA序列,”Elena Vizcaya說。此外,作者發(fā)現(xiàn)這些元素可能被物種(蒼蠅、老鼠和斑馬魚)中的一些保守基因激活。“再生特定調節(jié)元件的異位激活可能是提高不能再生器官再生能力的關鍵工具,”專家Montserrat Corominas總結道。

作為再生的模式動物,蒼蠅。

自古以來,再生就引起了人們極大的興趣,比如希臘神話中的傳說。然而,被稱為果蠅的果蠅的再生能力直到20世紀40年代才被發(fā)現(xiàn),當時是由一位再生醫(yī)學之父發(fā)現(xiàn)的。托馬斯摩根看到蒼蠅的成像盤(成體表皮結構中的原始盤)被打碎后可以再生。飛行被認為是研究再生的模型。

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