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新的計算機平臺有助于將癌癥患者與靶向治療試驗相匹配

隨著越來越多的癌癥患者對其腫瘤進行基因組分析,以及更多針對基因組改變的療法進入臨床試驗,將患者與他們有資格參加的試驗聯(lián)系起來的任務(wù)尤其具有挑戰(zhàn)性。Dana-Farber Cancer Institute 開發(fā)的計算機平臺使匹配過程變得更容易和更快,其設(shè)計師在一項新研究中報告說。

該平臺名為 MatchMiner,可幫助臨床醫(yī)生和臨床研究人員根據(jù)患者腫瘤的基因改變找到患者和靶向治療試驗之間的潛在匹配。在 Dana-Farber 的五年期間,它幫助獲得了大約五分之一的同意加入 MatchMiner 中具有基因組數(shù)據(jù)的患者的精準醫(yī)學試驗。發(fā)表在npj Precision Oncology上的該研究的作者發(fā)現(xiàn),它還將患者納入此類試驗的過程加快了 20% 以上。

“對患者腫瘤進行基因組改變分析已成為癌癥治療的一個廣泛部分,特別是當針對這些改變的新藥進入臨床試驗或被批準為癌癥治療方法時,”該研究的共同主要作者 Tali Mazor 博士說。與 Dana-Farber 的同事 Harry Klein 博士共同撰寫的論文。“不斷增長的基因組數(shù)據(jù)和越來越多的精準醫(yī)學試驗相結(jié)合,造成了一種脫節(jié):為每位患者找到合適的試驗可能是一項艱巨的任務(wù)。MatchMiner 有助于彌合這一差距。”

該平臺由 Dana-Farber 的 Knowledge Systems Group 開發(fā),由 Ethan Cerami 博士和醫(yī)學博士、公共衛(wèi)生碩士 Michael Hassett 領(lǐng)導(dǎo),借鑒了 Dana-Farber 在基因組分析和臨床研究方面的廣泛項目。在過去的十年中,該研究所的 40,000 多名患者對他們的腫瘤組織進行了分析,以了解 400 多個癌癥相關(guān)基因的變化。該研究所及其合作伙伴領(lǐng)導(dǎo)或參與了數(shù)千項臨床試驗,其中包括自 2017 年以來約 450 項涉及靶向治療的臨床試驗。2016 年推出的 MatchMiner 將這些系統(tǒng)連接起來,以幫助將患者與適當?shù)脑囼炏嗥ヅ洹?/p>

“腫瘤學家或其他臨床醫(yī)生可以使用 MatchMiner 來查找個體患者的試驗選擇,”Klein 評論道。“或者,試驗團隊可以使用它來識別潛在的試驗參與者,方法是設(shè)置一個基因組過濾器,篩選特定基因組標準的候選人。”

與大多數(shù)其他為單個癌癥中心設(shè)計的匹配平臺不同,MatchMiner 是開源的,可以被其他機構(gòu)采用。隨著 Dana-Farber 的新試驗開始,策展人會審查它們,以確定它們是否應(yīng)該包含在 MatchMiner 中,以確保平臺是最新的。截至 2021 年 3 月,354 項精準醫(yī)學試驗被整合到 MatchMiner 中。

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