人類基因組計(jì)劃產(chǎn)生了人類基因組的第一個(gè)序列，揭示了人類生物學(xué)的藍(lán)圖。二十年后，基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)領(lǐng)域描述了一個(gè)復(fù)雜的系統(tǒng)，其中數(shù)千個(gè)基因相互調(diào)節(jié)以創(chuàng)建適當(dāng)?shù)幕虮磉_(dá)動(dòng)態(tài)。
然而，需要做更多的工作來充分理解這些網(wǎng)絡(luò)并確定它們的精確性質(zhì)。目前的方法要么間接估計(jì)基因調(diào)控，要么利用準(zhǔn)確、直接但耗時(shí)的重復(fù)方法。
由京都大學(xué)領(lǐng)導(dǎo)的一個(gè)研究小組現(xiàn)已開發(fā)出一種高度準(zhǔn)確的方法來半自動(dòng)估計(jì)多細(xì)胞生物中的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。該方法涉及測(cè)量時(shí)間序列基因表達(dá)并應(yīng)用該團(tuán)隊(duì)專有的 RANGE 計(jì)算模型。該研究發(fā)表在《通訊生物學(xué)》雜志上。
京都大學(xué)生命與醫(yī)學(xué)科學(xué)研究所的通訊作者 Masato Ishikawa 表示：“RENGE 可能有助于識(shí)別細(xì)胞分化的關(guān)鍵因素，并有可能控制特定細(xì)胞的命運(yùn)。”
研究人員可以使用相對(duì)準(zhǔn)確的基因敲除方法來確定調(diào)節(jié)基因的表達(dá)，如果基因 A 被消除，那么 A 所調(diào)節(jié)的基因 B 就會(huì)暴露出來。
最新的單細(xì)胞 CRISPR 技術(shù)可以測(cè)量大規(guī)模個(gè)體基因敲除的表達(dá)變化，但有一個(gè)警告：直接和間接調(diào)控基因之間的區(qū)別尚不清楚。敲除一個(gè)基因不可避免地會(huì)影響網(wǎng)絡(luò)中順風(fēng)基因的表達(dá)。
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