由杰克遜實驗室 (JAX) 副教授 Vivek Kumar 博士領(lǐng)導(dǎo)的研究團隊開發(fā)了一種非侵入式方法,利用計算機視覺準確、連續(xù)地測量小鼠體重。該方法旨在減少與傳統(tǒng)稱重技術(shù)相關(guān)的壓力,提高涉及小鼠的生物醫(yī)學(xué)研究的質(zhì)量和可重復(fù)性。
在人類健康和生物醫(yī)學(xué)研究中,體重是一個關(guān)鍵指標(biāo),通常作為整體健康狀況的指標(biāo)和潛在健康問題的預(yù)測指標(biāo)。對于研究小鼠(臨床前研究中最常見的對象)的研究人員來說,測量體重傳統(tǒng)上需要將動物從籠子中取出并放在秤上。
這個過程會給小鼠帶來壓力,引入變量來影響實驗結(jié)果。此外,這些測量通常每隔幾天才進行一次,這進一步增加了數(shù)據(jù)準確性和可重復(fù)性的難度。
Kumar 表示:“我們認識到需要一種更好的方法來準確、無創(chuàng)地測量動物隨時間的質(zhì)量。傳統(tǒng)方法不僅給小鼠帶來壓力,還限制了測量的頻率和可靠性,從而削弱了實驗結(jié)果的有效性。”
為了應(yīng)對這一挑戰(zhàn),Kumar 和他的計算科學(xué)家和軟件工程師團隊(包括第一作者 Malachy Guzman、Brian Geuther 碩士和 Gautam Sabnis 博士)轉(zhuǎn)向了計算機視覺技術(shù)。Guzman 是卡爾頓學(xué)院的一名大四學(xué)生,曾是 JAX 的暑期學(xué)生,并以 Kumar 實驗室的學(xué)年實習(xí)生身份繼續(xù)了該項目。
通過分析 Kumar 之前用于評估梳理行為和步態(tài)姿勢的最大的小鼠視頻數(shù)據(jù)集之一,他們開發(fā)了一種誤差小于 5% 的體重計算方法。該研究結(jié)果發(fā)表在 8 月 7 日的《Patterns》高級在線版上,為研究人員提供了一種新資源,有望提高各種臨床前研究的質(zhì)量。
研究團隊在開發(fā)這種方法時面臨多項挑戰(zhàn)。與工業(yè)化養(yǎng)殖中用于測量體重的相對靜止的實驗對象不同,小鼠非?;钴S且靈活,經(jīng)常改變姿勢和形狀,就像一個可變形的物體。
此外,該團隊還研究了 62 種不同的小鼠品系,重量從 13 克到 45 克不等,每種小鼠都有獨特的大小、行為和毛色,因此需要使用多種視覺指標(biāo)、機器學(xué)習(xí)工具和統(tǒng)計模型才能達到所需的準確度。
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