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新技術使研究基因功能更快 更有效

貝勒醫(yī)學院的研究人員說,研究基因在基礎生物學和疾病中的作用現(xiàn)在更容易、更快、更有效。他們開發(fā)了一種基于藥物的遺傳平臺,使科學家能夠在實驗室果蠅中跟蹤遺傳操作,而無需篩選數(shù)千只果蠅。

研究人員在Cell Reports 中描述了這項新技術的基本原理及其應用示例。STAR Protocols中的一篇配套論文展示了如何設置、執(zhí)行和分析該技術中涉及的實驗程序。免費提供遺傳工具和資源,包括質粒庫,以幫助研究人員將這種新方法實施到他們的實驗系統(tǒng)中。

“實驗室果蠅是一種廣泛使用的動物模型,用于研究基因和突變對健康和疾病的生物過程的功能,”第一作者尼克·馬蒂揚博士說,他是Koen JT 博士的研究生。Venken在貝勒的實驗室從事這個項目。他目前是約翰霍普金斯大學醫(yī)學院的博士后研究員。

為了研究特定基因的功能,研究人員首先將其引入數(shù)以千計的果蠅中,然后逐個篩選果蠅以確定哪些果蠅成功整合了該基因。為了區(qū)分攜帶感興趣基因的果蠅和沒有攜帶感興趣基因的果蠅,在基因上添加了一種“標簽”。傳統(tǒng)上,這個標簽是在蒼蠅中很容易觀察到的物理特征。標簽可以是特定的眼睛顏色,例如紅色,因此研究人員知道紅眼睛的果蠅是攜帶研究基因的果蠅。體色、翅膀或體型是通常用于標記感興趣的遺傳特征的其他身體特征。

Verna 和 Marrs Mclean 的Venken助理教授說:“這個過程多年來一直運作良好,但一個主要的缺點是,在顯微鏡下逐個目視篩選數(shù)千只蒼蠅以尋找特定的身體特征會變得非常乏味和耗時。”貝勒生物化學和分子生物學系,該工作的共同通訊作者。

“在目前的工作中,我們開發(fā)了一個基于藥物的標記系統(tǒng),用于選擇或反選擇研究基因,顯著改善了篩選過程,”分子和人類遺傳學副教授Herman A. Dierick 博士說和貝勒的神經(jīng)科學以及該工作的共同通訊作者。

簡單的選擇與費力的篩選

這項新技術背后的想法是,不是用物理特征標記感興趣的基因,而是用另一個基因標記它們,該基因賦予果蠅對特定藥物的抗性或敏感性。研究人員現(xiàn)在可以使用該藥物在一組果蠅中選擇或反選擇攜帶感興趣基因的果蠅,而不是手動篩選身體特征。

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