麥克馬斯特大學的研究人員開發(fā)了一種復雜的新工具，可以幫助提供環(huán)境中罕見和未知病毒的早期預警，并識別導致敗血癥的潛在致命細菌病原體，以及其他用途。
新算法是一種先進的工具，可以幫助開發(fā)探針以捕獲各種情況下已知和未知的痕量病原體，例如 SARS-CoV-2 等感染的動物與人類傳播或監(jiān)測宿主在可能出現(xiàn)的病原體的環(huán)境中。
迄今為止，大多數(shù)實驗室都有大量測序樣本，這是一個費力且成本高昂的過程，通常需要科學家梳理并重新組裝特定 DNA 的微小片段，這些片段難以檢測并且經(jīng)常被同一樣本或環(huán)境中的數(shù)十億其他生物體污染.
例如，臨床或野生動物環(huán)境中的血液或唾液樣本中的病原體特別難以分離，因為它們很容易占樣本的不到百萬分之一，尤其是在感染的早期階段，此時濃度仍然很低而檢測對患者來說最為關(guān)鍵。
研究人員成功地在包括 SARS-CoV-2 在內(nèi)的整個家族上測試了這些探針。探針通過靶向、分離和識別相關(guān)生物之間共享的 DNA 序列(特別是同時)提供了一條捷徑，通常是由于進化歷史或祖先。
“有數(shù)以千計的細菌病原體，當時間非常重要時，能夠確定患者的血液樣本中存在哪種病原體可以更快地進行正確的治療，”該研究的主要作者、該研究的研究生 Zachery Dickson 解釋說。生物系。
“該探測器使識別速度更快，這意味著我們有可能拯救可能會死亡的人，”他說。
研究人員還證明了探針捕獲與敗血癥相關(guān)的極其廣泛的病原體的有效性.
“我們目前需要更快、更便宜和更簡潔的方法來檢測人類和環(huán)境樣本中的病原體，從而使狩獵民主化，而這條管道正是這樣做的，”該研究的主要作者兼麥克馬斯特古 DNA 中心主任、進化遺傳學家亨德里克·波納 (Hendrik Poinar) 說。 .
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