不同的疾病有不同的方法來(lái)測(cè)試一個(gè)人是否患有這種疾病。ImmunoML是一個(gè)新的開(kāi)源機(jī)器學(xué)習(xí)平臺(tái)，它可以在一個(gè)血液樣本中尋找很多疾病。
“一旦你知道它對(duì)一種疾病的作用，就可以很容易地為其他類型的疾病制作診斷工具，”Lonneke Scheffer 說(shuō)。
“從血液樣本中，我們希望能夠診斷一個(gè)人是否患有疾病。在個(gè)體受體水平上，我們希望了解一種特定受體是否對(duì)或其他物質(zhì)具有特異性，”Milena Pavlovic 說(shuō)。
Scheffer 和 Pavlovic 是奧斯陸大學(xué)信息學(xué)系的博士研究員。他們是生物醫(yī)學(xué)信息學(xué)研究小組的成員，在那里他們開(kāi)發(fā)了免疫機(jī)器學(xué)習(xí)。
預(yù)測(cè)受體是否與電暈結(jié)合
我們免疫系統(tǒng)中的 B 和 T 細(xì)胞表面都有小受體。有數(shù)百萬(wàn)種不同的受體。
“受體具有一定的 3D 形狀，使它們能夠粘附到不同的抗原上，”Scheffer 對(duì) Titan.uio.no 說(shuō)。
“如果我們使用機(jī)器學(xué)習(xí)來(lái)分析這些受體，我們希望能夠說(shuō)出這些受體中的每一個(gè)都有什么特異性;什么特定的疾病，什么特定的病毒或細(xì)菌，甚至是癌癥和自身免疫，”Pavlovic 說(shuō)。
為了使用機(jī)器學(xué)習(xí)來(lái)做到這一點(diǎn)，他們需要將 3D 形狀的受體翻譯成數(shù)學(xué)語(yǔ)言，翻譯成數(shù)學(xué)表示。受體是蛋白質(zhì)，所有蛋白質(zhì)在我們的 DNA 中都有自己的藍(lán)圖。
“然后我們正在查看一條扁平的小字母線。這些 DNA 序列是我們輸入的，我們可以在計(jì)算機(jī)中將其翻譯成蛋白質(zhì)序列。要預(yù)測(cè)受體是否與日冕結(jié)合，你真的只需看一個(gè)一段文本，你想根據(jù)這段文本進(jìn)行預(yù)測(cè)，它是否與電暈結(jié)合，”Scheffer 說(shuō)。
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