預(yù)測(cè)植入前受精胚胎中一些常見疾病的風(fēng)險(xiǎn)

胚胎植入前基因檢測(cè)

體外受精胚胎的植入前基因檢測(cè)使研究人員能夠在植入前確定是否存在任何潛在的遺傳疾病。基因檢測(cè)目前用于預(yù)防罕見的孟德爾疾病。

一些研究還測(cè)試了胚胎的心臟病和癌癥。這些研究使用了多基因風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分 (PRS)，其中將多個(gè)遺傳變異的影響組合成一個(gè)預(yù)測(cè)因子。

用于基因檢測(cè)的 DNA 材料是從單細(xì)胞或少細(xì)胞胚胎活檢中獲得的，這會(huì)限制用于測(cè)序的 DNA 的數(shù)量和質(zhì)量。因此，胚胎的全面基因組分析是成本和時(shí)間密集型的。此外，由于多種技術(shù)原因，可能會(huì)導(dǎo)致基因組圖譜不準(zhǔn)確，這也可能妨礙對(duì)罕見基因突變的準(zhǔn)確檢測(cè)。

全基因組重建

在目前的研究中，110 個(gè)胚胎來自 10 對(duì)接受體外受精(IVF) 并進(jìn)行過臨床植入前基因檢測(cè)的夫婦。十名通過體外受精出生的孩子獲得了 DNA，所有這些孩子都獲得了植入前基因檢測(cè)結(jié)果。非整倍體植入前基因檢測(cè)結(jié)果顯示，68 個(gè)胚胎為整倍體，42 個(gè)胚胎具有一條或多條非整倍體染色體。

胚胎的全基因組重建是通過對(duì)父母雙方進(jìn)行基因組測(cè)序和兄弟胚胎的陣列測(cè)量來實(shí)現(xiàn)的。分子和統(tǒng)計(jì)方法的結(jié)合被用來將親本變體與對(duì)應(yīng)于個(gè)體染色體的“單倍型”聯(lián)系起來。

確定每個(gè)胚胎的減數(shù)分裂重組的位置。此外，組裝相關(guān)的單倍型片段以近似整個(gè)遺傳的胚胎基因組。

全基因組重建的準(zhǔn)確性評(píng)估為

將預(yù)測(cè)的基因型與出生孩子的基因型進(jìn)行比較。預(yù)計(jì)胚胎中平均有 580 萬個(gè)位點(diǎn)，范圍從 5.4 到 640 萬個(gè)變體。與出生的孩子相比，第三天胚胎活檢的預(yù)測(cè)準(zhǔn)確度為 96.3-98.4%，第五天胚胎活檢的預(yù)測(cè)準(zhǔn)確率為 98.0-98.9%。

在四對(duì)夫婦中，進(jìn)行了轉(zhuǎn)座酶連接長(zhǎng)讀長(zhǎng)測(cè)序 (TELL-Seq) 以進(jìn)行文庫制備。這捕獲了稀有變體，增加了每個(gè)家族中稀有變體預(yù)測(cè)的數(shù)量和準(zhǔn)確性。

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