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增強(qiáng)表觀遺傳時鐘的可靠性

導(dǎo)讀 表觀遺傳時鐘是基于DNA甲基化的強(qiáng)大生物標(biāo)志物,用于追蹤人口研究、臨床試驗和個人健康應(yīng)用中的衰老。旨在測量生物學(xué)年齡,它們強(qiáng)烈預(yù)測與

表觀遺傳時鐘是基于DNA甲基化的強(qiáng)大生物標(biāo)志物,用于追蹤人口研究、臨床試驗和個人健康應(yīng)用中的衰老。旨在測量生物學(xué)年齡,它們強(qiáng)烈預(yù)測與年齡相關(guān)的發(fā)病率和死亡率以及健康的其他方面。現(xiàn)在,耶魯大學(xué)醫(yī)學(xué)院的科學(xué)家與國際研究同事合作,開發(fā)了一種新方法,使它們更加可靠。

根據(jù)發(fā)表在《自然衰老》雜志上的這項研究,當(dāng)從同一個血液樣本中估計出兩個或多個測量值(稱為技術(shù)復(fù)制)時,使用先前開發(fā)的時鐘估計一個人的表觀遺傳年齡通??赡芟嗖?年。這種噪音限制了表觀遺傳時鐘的效用,特別是對于跟蹤這些測量隨時間變化的縱向研究。

然而,以前在耶魯大學(xué)醫(yī)學(xué)院的MorganLevine博士實驗室的一種新方法能夠幾乎完全減少這種差異。AlbertHiggins-Chen醫(yī)學(xué)博士、精神病學(xué)助理教授和該論文的第一作者表示,新的計算方法可用于從旨在預(yù)測衰老和死亡率的生化測試中分離和消除“技術(shù)噪音”。

“表觀遺傳時鐘的重測可靠性受到的關(guān)注相對較少,”Higgins-Chen說。“我們發(fā)現(xiàn)了表觀遺傳時鐘,在一次測試中可以說你在生物學(xué)上是50歲,然后在下一次測試中是59歲。我們從現(xiàn)有的常用時鐘開始,發(fā)現(xiàn)了一個單一的變化——增加了一種稱為主成分分析的技術(shù)——可以保留老化信號,同時顯著降低噪音?,F(xiàn)在,對于大多數(shù)測試,同時進(jìn)行的兩次測量將相差不到一年。這也意味著一個人的縱向時鐘變化更有可能反映真正的生物老化而不是技術(shù)噪音。”

這些發(fā)現(xiàn)對從流行病學(xué)研究到臨床試驗的應(yīng)用具有重要意義。這些新開發(fā)的表觀遺傳時鐘預(yù)測疾病和衰老的結(jié)果與傳統(tǒng)時鐘相似,但在縱向跟蹤時它們也顯示出更穩(wěn)定的軌跡。該團(tuán)隊進(jìn)一步證明,當(dāng)使用表觀遺傳時鐘作為臨床終點時,使用新的表觀遺傳時鐘版本可以大大減少干預(yù)測試和臨床試驗中的樣本量需求。

MorganLevine博士——在她最近搬到Altos實驗室之前曾領(lǐng)導(dǎo)耶魯大學(xué)病理學(xué)系生命系統(tǒng)衰老實驗室——警告說,“雖然表觀遺傳時鐘作為衰老的生物標(biāo)志物顯示出很多希望,但我們需要如果我們想有一天用它們來測試對衰老和疾病的干預(yù)措施,就繼續(xù)努力使這些措施更加可靠和有效。”

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