模式生物對于生物醫(yī)學(xué)研究至關(guān)重要，并促成了許多重要的科學(xué)發(fā)現(xiàn)。對這些模型的基因組進行測序的能力是研究影響人類健康的遺傳因素的有力工具。
家鼠(Mus musculus) 和挪威大鼠 (Rattus norvegicus) 由于與人類的遺傳相似性而被廣泛用于研究。但是另一只嚙齒動物正在崛起——;Arvicanthis niloticus，尼羅河鼠。
今天發(fā)表在BMC Biology上的新研究為尼羅河大鼠提供了高質(zhì)量的參考基因組組裝，擴大了其作為模式生物的潛力。
我們需要研究工具，使我們能夠?qū)δ崃_河大鼠做同樣的事情，就像我們過去對實驗室老鼠所做的那樣。擁有參考基因組是朝著這個目標邁進的一步。”
Yury Bukhman，Morgridge 斯圖爾特計算生物學(xué)小組的計算生物學(xué)家，該項目的資深作者
特別是，在實驗室小鼠和大鼠存在局限性的兩個研究領(lǐng)域中，尼羅河大鼠可作為替代模型。2 型糖尿病和與晝夜節(jié)律紊亂相關(guān)的疾病。
小鼠和大鼠是夜行動物，因此它們在模擬人類晝夜周期方面的價值較低。此外，他們可以通過高脂肪飲食出現(xiàn)糖尿病前期癥狀，但很少會出現(xiàn)像患有這種疾病的人類那樣的長期糖尿病并發(fā)癥。
“你可以改變它們的基因，你可以給它們大量的脂肪，或者使用化學(xué)物質(zhì)來加速這個過程。但這是你正在推動動物模型以獲得你想要的東西的許多額外的混雜因素，”第一作者說Huishi Toh 是加州大學(xué)圣塔芭芭拉分校的助理項目科學(xué)家，曾與 Morgridge 再生生物學(xué)名譽主任、UCSB 教授 Jamie Thomson 一起工作。
尼羅河鼠是晝夜活動的，在白天像人類一樣活躍。然而，與夜間活動的嚙齒動物相比，它的眼睛中也有更多的光感受器，這使得它與研究人類視網(wǎng)膜疾病有關(guān)——;包括糖尿病視網(wǎng)膜病變。
“在 2 型糖尿病中仍有很多發(fā)現(xiàn)的空間，問題難以回答。這就是為什么我們認為也許是時候在新的動物模型上冒險了，”Toh 說。“這是否意味著它更準確，或者您可以替換其他模型?不，當(dāng)然不是。但是您也可以找到有用的不同信息。”
尼羅河大鼠的另一個好處是它可以作為遠交模型，這意味著它的遺傳學(xué)反映了不同的種群。許多實驗室小鼠品系已經(jīng)進行了幾代人的近交，產(chǎn)生了幾乎基因相同的穩(wěn)定種群。這對于減少實驗變異性很有用，但在研究導(dǎo)致疾病的復(fù)雜遺傳因素時用處不大。
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