在預(yù)測物種豐富度時,體型似乎是一個基本且可重復(fù)的預(yù)測因素,體型較小的生物比體型較大的生物數(shù)量更多。有一點需要注意,即所謂的伯曼規(guī)則,即在極地地區(qū),體型較大的生物占主導(dǎo)地位。影響物種豐富度的其他因素包括光照、食物供應(yīng)、競爭和捕食。
阿肯色大學(xué)生物科學(xué)研究小組的新發(fā)現(xiàn)為我們了解物種豐富度增加了遺傳因素。
基因組大小,即單個完整基因組的一個拷貝中所含的 DNA 總量,也可以作為物種豐度的有力預(yù)測指標(biāo)。該論文研究了硅藻,這是一種在淡水和海洋食物網(wǎng)中發(fā)揮重要作用的單細(xì)胞藻類。它們產(chǎn)生長鏈脂肪酸,如魚油和其他脂質(zhì),作為能量。硅藻產(chǎn)生的能量分子沿著食物網(wǎng)向上傳遞,從浮游動物到水生昆蟲,再到魚類,再到人類。
硅藻在光合作用中也發(fā)揮著重要作用,光合作用是將二氧化碳轉(zhuǎn)化為氧氣的過程。據(jù)估計,地球上 20%-25% 的氧氣來自硅藻,比雨林和陸地植物的氧氣還要多。
關(guān)鍵發(fā)現(xiàn)是溫度和基因組大小(而非體型)對硅藻的最大種群增長率影響最大。然而,體型在較冷的緯度地區(qū)仍然很重要,這符合伯曼定律。
這篇題為《通過基因組大小預(yù)測極地海洋中硅藻的豐度》的論文由生物科學(xué)系的三位作者發(fā)表在《PLOS Biology》上:阿爾弗森實驗室的博士后研究員韋德·羅伯茨;副教授亞當(dāng)·西皮爾斯基;以及阿爾弗森實驗室教授兼主任安德魯·阿爾弗森。
羅伯茨指出,硅藻的基因組大小對于細(xì)胞功能及其適應(yīng)不斷變化的環(huán)境的能力至關(guān)重要。
“在浮游植物中,細(xì)胞大小與基因組大小高度相關(guān),”羅伯茨解釋道。“我們早就知道這一點了。但我們不確定是細(xì)胞大小決定了基因組大小還是反之亦然。我們能夠通過路徑分析直接測試這一點以確定方向性。我們發(fā)現(xiàn)基因組大小的增加導(dǎo)致細(xì)胞大小的增加。因此,我們確認(rèn)基因組大小決定了細(xì)胞大小。”
不同物種的硅藻基因組大小可能相差 50 倍,但遺傳物質(zhì)的差異大部分是由重復(fù) DNA 構(gòu)成的。DNA 編碼構(gòu)成生命基石的蛋白質(zhì),但尚不清楚細(xì)胞如何利用這些重復(fù) DNA。據(jù)估計,只有約 2% 的人類基因組編碼基因。
總體而言,該論文的結(jié)果表明,所有生命的基本特征——基因組的大小,可以預(yù)測全球范圍內(nèi)的物種豐富度,從而促進(jìn)了對物種豐富度的理解。
“大型生物在極地地區(qū)更為豐富,”羅伯茨說。“哺乳動物和其他多細(xì)胞生物確實如此。但我們不知道浮游植物是否也是如此?,F(xiàn)在我們可以根據(jù)溫度預(yù)測群落組成。這將幫助我們預(yù)測大型硅藻是否能夠在變暖的水域中生存。”
在一個變暖的地球上,這可能意味著大細(xì)胞硅藻的減少和氧氣輸出量的潛在下降。
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